60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1801 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1801  stage III sporulation protein AA  100 
 
 
294 aa  586  1e-166  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2087  stage III sporulation protein AA  98.3 
 
 
294 aa  580  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.963065  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1525  AAA ATPase  46.43 
 
 
332 aa  290  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0931  stage III sporulation protein AA  41.32 
 
 
308 aa  266  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.719213 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4303  stage III sporulation protein AA  41.32 
 
 
308 aa  265  5e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2336  stage III sporulation protein AA  42.23 
 
 
308 aa  265  7e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4323  stage III sporulation protein AA  40.62 
 
 
308 aa  265  8e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4097  stage III sporulation protein AA  40.62 
 
 
308 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3935  stage III sporulation protein AA  40.62 
 
 
308 aa  264  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3946  stage III sporulation protein AA  40.62 
 
 
308 aa  264  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4213  stage III sporulation protein AA  40.62 
 
 
308 aa  264  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0252456 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4417  stage III sporulation protein AA  40.62 
 
 
308 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1007  AAA ATPase  41.5 
 
 
332 aa  264  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0845  stage III sporulation protein spoIIIAA  43.51 
 
 
336 aa  263  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000346466  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4266  stage III sporulation protein AA  40.28 
 
 
308 aa  263  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4046  sporulation stage III protein AA  40.28 
 
 
308 aa  262  6e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2887  sporulation stage III protein AA  40.28 
 
 
307 aa  259  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2611  stage III sporulation protein AA  40.78 
 
 
345 aa  259  6e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06170  Sporulation stage III protein AA  44.77 
 
 
316 aa  257  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0235  stage III sporulation protein AA  39.86 
 
 
306 aa  257  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1536  hypothetical protein  40.13 
 
 
350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.127679 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2524  stage III sporulation protein AA  41.52 
 
 
322 aa  253  3e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1916  stage III sporulation protein AA  41.34 
 
 
331 aa  251  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1686  stage III sporulation protein AA  40.61 
 
 
323 aa  249  4e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1713  stage III sporulation protein AA  42.36 
 
 
322 aa  246  4e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0550  stage III sporulation protein spoIIIAA  43.46 
 
 
313 aa  243  3e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.852342  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1056  hypothetical protein  38.31 
 
 
337 aa  242  6e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0117191  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1793  stage III sporulation protein AA  37.74 
 
 
334 aa  235  7e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3516  stage III sporulation protein AA  37.23 
 
 
361 aa  230  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00709627  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0990  AAA ATPase  39.67 
 
 
313 aa  199  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0528  AAA ATPase  28.35 
 
 
318 aa  92.4  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.162948 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0513  AAA ATPase  29.57 
 
 
322 aa  92.4  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.203614 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2960  AAA ATPase  29.84 
 
 
322 aa  89.4  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4555  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  27.64 
 
 
605 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3621  AAA ATPase  26.95 
 
 
386 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3015  single-stranded nucleic acid binding R3H  27.94 
 
 
590 aa  83.6  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0100908 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0032  AAA ATPase  27.84 
 
 
445 aa  83.2  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0126  single-stranded nucleic acid binding R3H  25.18 
 
 
579 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0684  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  27.27 
 
 
551 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0786  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  25.45 
 
 
515 aa  77.4  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1201  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  26.37 
 
 
602 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1230  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  26.37 
 
 
602 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.479745  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3721  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  27.11 
 
 
538 aa  75.5  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059695 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0625  single-stranded nucleic acid binding R3H  25.09 
 
 
588 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.57022  normal  0.210072 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2072  single-stranded nucleic acid-binding R3H domain-containing protein  25.45 
 
 
579 aa  73.6  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0703  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  26.47 
 
 
509 aa  73.2  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_683  R3H domain protein  26.84 
 
 
537 aa  73.2  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2975  single-stranded nucleic acid binding R3H  32.45 
 
 
496 aa  72.4  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.38424  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4406  predicted protein  25.63 
 
 
335 aa  72  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.746499 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2939  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  27.14 
 
 
540 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  normal  0.269188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0499  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  26.28 
 
 
565 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000861102  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3233  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  26.64 
 
 
538 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.384079  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0872  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  26.02 
 
 
515 aa  69.3  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.559562  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0600  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  26.42 
 
 
584 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767642  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0777  R3H domain-containing protein  25.37 
 
 
509 aa  68.9  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.191929  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_1953  predicted protein  22.79 
 
 
552 aa  69.3  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0379  ATPase  24.34 
 
 
546 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.788965  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22991  AAA ATPase superfamily protein  30.72 
 
 
545 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1951  ATPase  30.68 
 
 
539 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1842  ABC transporter  25 
 
 
313 aa  45.4  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>