15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2617 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2617  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0815207  hitchhiker  0.00770419 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  38.41 
 
 		 1727 aa  68.9  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2877  hypothetical protein  34.17 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.848063  hitchhiker  0.00421262 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43412  predicted protein  27.62 
 
 		 454 aa  49.7  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43495  predicted protein  30.83 
 
 		 452 aa  49.3  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00000588522  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2324  hypothetical protein  32.37 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2328  hypothetical protein  57.58 
 
 		 181 aa  46.6  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  34.25 
 
 		 840 aa  45.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0792  hypothetical protein  37.97 
 
 		 185 aa  45.1  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43513  predicted protein  33.33 
 
 		 450 aa  45.1  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.868692  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43494  predicted protein  29.86 
 
 		 456 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0119061  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  30.05 
 
 		 1217 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1335  hypothetical protein  62.07 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.128614  normal  0.0757331 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1995  hypothetical protein  50 
 
 		 239 aa  41.6  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00112898  normal  0.836416 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43460  predicted protein  28.57 
 
 		 515 aa  41.6  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>