51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3087 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3087  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  310  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3980  hypothetical protein  31.43 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000140585  hitchhiker  0.00000110352 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4681  glycosyl transferase family protein  31 
 
 		 345 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627848  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1309  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 272 aa  47.8  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 		 443 aa  47.4  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  30.28 
 
 		 442 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  32.46 
 
 		 442 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0561  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 		 334 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1778  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 292 aa  44.7  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 		 445 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  32.69 
 
 		 350 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5026  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 		 485 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 		 310 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 		 324 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 		 983 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0478  glycosyl transferase family protein  38.33 
 
 		 300 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  31.96 
 
 		 442 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51220  glycosyl transferase  35.37 
 
 		 330 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00120111  hitchhiker  0.000215045 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18491  glycosyl transferase family protein  23.31 
 
 		 433 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.249822  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4731  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 		 485 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.08 
 
 		 327 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4643  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 		 485 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1962  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 		 257 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.610471  hitchhiker  0.000090179 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 		 327 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.12 
 
 		 327 aa  43.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  37.1 
 
 		 296 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  30.85 
 
 		 328 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  27.08 
 
 		 327 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 		 428 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  27.08 
 
 		 327 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5156  family 2 glycosyl transferase  33.33 
 
 		 216 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  24.35 
 
 		 412 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.08 
 
 		 327 aa  42.4  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 299 aa  42.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.08 
 
 		 327 aa  42.4  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0221  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 		 368 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 		 338 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0402  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 		 359 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.20489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0172  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 255 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2356  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 		 380 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1969  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 		 267 aa  41.2  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.442376  hitchhiker  0.0000000978306 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2900  glycosyl transferase family 2  26.52 
 
 		 349 aa  40.8  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0088  hypothetical protein  23.91 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00675009  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0648  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 340 aa  40.4  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 		 273 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  35.48 
 
 		 286 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 		 351 aa  40.4  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2342  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 		 307 aa  40.4  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0212  glycosyl transferase family 2  38.57 
 
 		 334 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  37.97 
 
 		 376 aa  40.4  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  29 
 
 		 294 aa  40.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.811113 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>