41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1849 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1849  ABC-type molybdate transport system, periplasmic component  100 
 
 		 274 aa  565  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0310  ABC-transporter-like protein, periplasmic substrate-binding protein  52.43 
 
 		 275 aa  293  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0979  hypothetical protein  52.55 
 
 		 273 aa  288  8e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446553  normal  0.0586642 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0640  extracellular solute-binding protein family 1  42.59 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0178146  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0379  extracellular solute-binding protein  38.17 
 
 		 321 aa  190  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.961539  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2087  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  39.13 
 
 		 327 aa  166  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28403e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2634  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  36.79 
 
 		 326 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000273776  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2354  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  37.23 
 
 		 325 aa  161  9e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000506174  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0525  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  35.96 
 
 		 326 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2058  extracellular solute-binding protein family 1  31.64 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00930598  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2084  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  34.2 
 
 		 354 aa  146  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1880  extracellular solute-binding protein  32.76 
 
 		 355 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1405  extracellular solute-binding protein family 1  34.48 
 
 		 329 aa  143  4e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.692378  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1756  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  32.07 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0954  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  30.34 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1019  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  32.38 
 
 		 347 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.884237  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2302  extracellular solute-binding protein family 1  32.66 
 
 		 636 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.319071  normal  0.250502 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1022  extracellular solute-binding protein family 1  28.83 
 
 		 318 aa  118  9e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0925  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  31.03 
 
 		 344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1470  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.79 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.811914  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2240  ABC-type molybdate transport system periplasmic component-like protein  30.85 
 
 		 341 aa  112  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0010  ABC-type molybdate transport system periplasmic component-like protein  31.98 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2123  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.55 
 
 		 307 aa  96.3  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.04669  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1498  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.64 
 
 		 307 aa  96.3  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00436727  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1216  extracellular solute-binding protein family 1  27.64 
 
 		 307 aa  96.3  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000268953  unclonable  0.0000000000401052 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1025  tungstate/molybdate binding protein  25.42 
 
 		 328 aa  92.4  6e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0403292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0707  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2497  tungstate/molybdate binding protein  30 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102491 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1653  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1225  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 306 aa  75.5  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000686455 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1406  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.130817  normal  0.506549 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1190  tungstate/molybdate binding protein  32.79 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0768198  normal  0.72552 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1780  tungstate/molybdate binding protein  25.11 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0507  ABC-type molybdate transport system periplasmic component-like protein  24.4 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.701895  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2001  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 		 402 aa  59.3  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1934  tungstate/molybdate binding protein  26.67 
 
 		 317 aa  53.5  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0273271  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8652  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0168  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  20.07 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1370  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  20.18 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.215303  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2906  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  20.28 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000609302  hitchhiker  0.0000154975 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0577  putative molybdenum ABC transporter, solute-binding protein  43.9 
 
 		 284 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>