93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0525 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0525  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 		 326 aa  679    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2634  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  68.55 
 
 		 326 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000273776  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2087  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  69.4 
 
 		 327 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28403e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2354  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  64.87 
 
 		 325 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000506174  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2084  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  60 
 
 		 354 aa  409  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0640  extracellular solute-binding protein family 1  54.35 
 
 		 335 aa  317  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0178146  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0379  extracellular solute-binding protein  44.11 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.961539  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2058  extracellular solute-binding protein family 1  45.64 
 
 		 316 aa  263  3e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00930598  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1880  extracellular solute-binding protein  43.49 
 
 		 355 aa  257  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0925  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  37.11 
 
 		 344 aa  223  4e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1019  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  36.52 
 
 		 347 aa  220  3e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.884237  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1756  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  38.14 
 
 		 347 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0954  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  37.27 
 
 		 330 aa  210  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1025  tungstate/molybdate binding protein  35.76 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0403292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0310  ABC-transporter-like protein, periplasmic substrate-binding protein  38.32 
 
 		 275 aa  189  8e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1470  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  36.27 
 
 		 349 aa  188  9e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.811914  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1405  extracellular solute-binding protein family 1  35.97 
 
 		 329 aa  186  3e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.692378  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0979  hypothetical protein  34.96 
 
 		 273 aa  155  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446553  normal  0.0586642 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2302  extracellular solute-binding protein family 1  33.78 
 
 		 636 aa  155  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.319071  normal  0.250502 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1849  ABC-type molybdate transport system, periplasmic component  35.96 
 
 		 274 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2240  ABC-type molybdate transport system periplasmic component-like protein  30.14 
 
 		 341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1406  extracellular solute-binding protein family 1  29.15 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.130817  normal  0.506549 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1653  extracellular solute-binding protein family 1  31.08 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1022  extracellular solute-binding protein family 1  28.27 
 
 		 318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1225  extracellular solute-binding protein family 1  29.43 
 
 		 306 aa  103  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000686455 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1216  extracellular solute-binding protein family 1  28.43 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000268953  unclonable  0.0000000000401052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1498  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28.43 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00436727  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2497  tungstate/molybdate binding protein  28.26 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102491 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0507  ABC-type molybdate transport system periplasmic component-like protein  27.65 
 
 		 393 aa  96.3  6e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.701895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1780  tungstate/molybdate binding protein  28.24 
 
 		 366 aa  92.8  8e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1190  tungstate/molybdate binding protein  26.49 
 
 		 296 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0768198  normal  0.72552 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0707  extracellular solute-binding protein family 1  26.57 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0010  ABC-type molybdate transport system periplasmic component-like protein  27.08 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2123  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.83 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.04669  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2001  extracellular solute-binding protein family 1  24.01 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8652  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0571  molybdenum ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  26.03 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3965  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.4 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000683458  normal  0.0526206 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3851  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.4 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1934  tungstate/molybdate binding protein  23.93 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0273271  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2040  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  31.16 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2732  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.78 
 
 		 248 aa  57  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6804  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.49 
 
 		 257 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000025189 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0106  putative molybdate-binding periplasmic signal peptide protein  25.52 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.173148 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2220  molybdate ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  31.01 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.35326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1553  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.85 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0473585  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1950  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.76 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.892745  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2848  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  25.83 
 
 		 257 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3859  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  31.09 
 
 		 262 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1581  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.21 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11885  molybdate-binding lipoprotein modA  26.47 
 
 		 261 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.189903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2545  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27 
 
 		 255 aa  49.7  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.778836  normal  0.889945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2274  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.36 
 
 		 274 aa  49.3  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.366108  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3860  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25 
 
 		 289 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0644367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1853  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  29.03 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.682841  normal  0.0173526 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4504  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25 
 
 		 289 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0793086  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3667  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25 
 
 		 264 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341489  normal  0.497229 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1207  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.03 
 
 		 265 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2559  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  35.16 
 
 		 268 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00486814  normal  0.114407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0634  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  25.29 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2580  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdenum-binding protein  24.01 
 
 		 252 aa  47  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0748  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.53 
 
 		 266 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2302  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  29.41 
 
 		 255 aa  47  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9031  ABC-type molybdate transporter, substrate- binding protein  33.33 
 
 		 263 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2236  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  24.08 
 
 		 291 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.607578  normal  0.187927 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0035  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  31.03 
 
 		 246 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155625 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2010  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.91 
 
 		 268 aa  46.2  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.233291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0328  molybdenum ABC transporter, periplasmic binding protein  27.1 
 
 		 255 aa  46.2  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.143655  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0045  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  32.18 
 
 		 234 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0054  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  32.18 
 
 		 234 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0160999  normal  0.0260306 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1069  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  35.37 
 
 		 252 aa  46.2  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3228  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.9 
 
 		 265 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.682348 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3757  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.83 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0635929 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0299  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.83 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2906  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  33.67 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000609302  hitchhiker  0.0000154975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34140  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  32.29 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.10838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3697  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.74 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2538  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  30.65 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.279543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2901  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  34.78 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1674  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.83 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3483  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  30.25 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1478  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.83 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.310787  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0330  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.83 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0867  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.83 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.291111  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2054  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  30.51 
 
 		 256 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3748  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  35.48 
 
 		 270 aa  43.9  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1319  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  38.1 
 
 		 272 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4970  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.81 
 
 		 265 aa  43.5  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2474  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  31.07 
 
 		 260 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2427  molybdate ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.83 
 
 		 277 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2564  molybdate ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.83 
 
 		 277 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0593  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.57 
 
 		 354 aa  43.1  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4405  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.08 
 
 		 259 aa  42.4  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.216941  normal  0.212386 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>