36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1934 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1934  tungstate/molybdate binding protein  100 
 
 		 317 aa  628  1e-179  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0273271  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2240  ABC-type molybdate transport system periplasmic component-like protein  38.85 
 
 		 341 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1498  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  36.05 
 
 		 307 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00436727  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1216  extracellular solute-binding protein family 1  36.05 
 
 		 307 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000268953  unclonable  0.0000000000401052 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2497  tungstate/molybdate binding protein  37.36 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102491 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0010  ABC-type molybdate transport system periplasmic component-like protein  36.07 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2123  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  32.33 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.04669  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0707  extracellular solute-binding protein family 1  32.63 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1190  tungstate/molybdate binding protein  31.07 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0768198  normal  0.72552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8652  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1022  extracellular solute-binding protein family 1  30.89 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1405  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.692378  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1653  extracellular solute-binding protein family 1  29.89 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1780  tungstate/molybdate binding protein  28.2 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0379  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.961539  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1470  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.08 
 
 		 349 aa  69.3  0.00000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.811914  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0640  extracellular solute-binding protein family 1  26.93 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0178146  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2354  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  27.56 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000506174  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1406  extracellular solute-binding protein family 1  27.8 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.130817  normal  0.506549 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1225  extracellular solute-binding protein family 1  28.02 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000686455 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2084  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.43 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1756  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.28 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2634  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.03 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000273776  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0525  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  23.93 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2001  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0925  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.31 
 
 		 344 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2058  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00930598  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1019  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.58 
 
 		 347 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.884237  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0310  ABC-transporter-like protein, periplasmic substrate-binding protein  24.03 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0979  hypothetical protein  25.54 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446553  normal  0.0586642 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1849  ABC-type molybdate transport system, periplasmic component  26.67 
 
 		 274 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1880  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 355 aa  52.8  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0954  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  20.16 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2087  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.04 
 
 		 327 aa  50.1  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28403e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2302  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 		 636 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.319071  normal  0.250502 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0507  ABC-type molybdate transport system periplasmic component-like protein  25.37 
 
 		 393 aa  42.4  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.701895  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>