49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0310 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0310  ABC-transporter-like protein, periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 		 275 aa  564  1e-160  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1849  ABC-type molybdate transport system, periplasmic component  52.43 
 
 		 274 aa  293  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0979  hypothetical protein  52.06 
 
 		 273 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446553  normal  0.0586642 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0640  extracellular solute-binding protein family 1  41.13 
 
 		 335 aa  217  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0178146  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0379  extracellular solute-binding protein  37.88 
 
 		 321 aa  204  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.961539  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2084  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  38.83 
 
 		 354 aa  189  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0525  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  38.32 
 
 		 326 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2354  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  37.96 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000506174  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2087  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  38.77 
 
 		 327 aa  183  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28403e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2634  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  37.23 
 
 		 326 aa  182  7e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000273776  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2058  extracellular solute-binding protein family 1  32.13 
 
 		 316 aa  172  5.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00930598  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1880  extracellular solute-binding protein  34.71 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1405  extracellular solute-binding protein family 1  32.08 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.692378  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1019  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  31.49 
 
 		 347 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.884237  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0925  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  31.49 
 
 		 344 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1756  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  31.14 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0954  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.41 
 
 		 330 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1470  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.21 
 
 		 349 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.811914  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1025  tungstate/molybdate binding protein  28.87 
 
 		 328 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0403292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2302  extracellular solute-binding protein family 1  26.99 
 
 		 636 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.319071  normal  0.250502 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0010  ABC-type molybdate transport system periplasmic component-like protein  33.66 
 
 		 304 aa  105  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1216  extracellular solute-binding protein family 1  28.24 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000268953  unclonable  0.0000000000401052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1498  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28.24 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00436727  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2497  tungstate/molybdate binding protein  29.5 
 
 		 297 aa  102  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102491 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2240  ABC-type molybdate transport system periplasmic component-like protein  28.16 
 
 		 341 aa  99.4  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1022  extracellular solute-binding protein family 1  29.78 
 
 		 318 aa  99.4  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0707  extracellular solute-binding protein family 1  29.76 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2123  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.45 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.04669  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1225  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000686455 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1780  tungstate/molybdate binding protein  24.23 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1653  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1406  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.130817  normal  0.506549 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1190  tungstate/molybdate binding protein  26.35 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0768198  normal  0.72552 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2001  extracellular solute-binding protein family 1  22.38 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0507  ABC-type molybdate transport system periplasmic component-like protein  24.05 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.701895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2220  molybdate ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  31.45 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.35326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1934  tungstate/molybdate binding protein  24.03 
 
 		 317 aa  54.3  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0273271  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2822  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.38 
 
 		 240 aa  50.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000384753  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2274  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  20.96 
 
 		 274 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.366108  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1319  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.89 
 
 		 272 aa  46.2  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34140  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.54 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.10838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2538  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  20.63 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.279543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0035  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  38.6 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155625 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0571  molybdenum ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  20.36 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1069  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.85 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3483  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.68 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0045  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  38.6 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0054  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  38.6 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0160999  normal  0.0260306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1099  molybdenum ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  26.05 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594829  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>