82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2634 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2634  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 
326 aa  678    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000273776  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0525  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  68.55 
 
 
326 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2087  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  70.19 
 
 
327 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28403e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2354  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  64.12 
 
 
325 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000506174  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2084  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  57.19 
 
 
354 aa  402  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0640  extracellular solute-binding protein family 1  49.84 
 
 
335 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0178146  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0379  extracellular solute-binding protein  43.97 
 
 
321 aa  283  4.0000000000000003e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.961539  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2058  extracellular solute-binding protein family 1  43.9 
 
 
316 aa  250  2e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00930598  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1880  extracellular solute-binding protein  39.62 
 
 
355 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0954  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  35.58 
 
 
330 aa  206  6e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0925  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  36.14 
 
 
344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1756  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  36.11 
 
 
347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1019  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  35.19 
 
 
347 aa  196  6e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.884237  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1405  extracellular solute-binding protein family 1  36.86 
 
 
329 aa  192  7e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.692378  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1470  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  36.36 
 
 
349 aa  191  2e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.811914  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0310  ABC-transporter-like protein, periplasmic substrate-binding protein  37.23 
 
 
275 aa  182  9.000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0979  hypothetical protein  37.87 
 
 
273 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446553  normal  0.0586642 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1025  tungstate/molybdate binding protein  32.11 
 
 
328 aa  167  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0403292  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1849  ABC-type molybdate transport system, periplasmic component  36.79 
 
 
274 aa  165  9e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2302  extracellular solute-binding protein family 1  31.86 
 
 
636 aa  147  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.319071  normal  0.250502 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2240  ABC-type molybdate transport system periplasmic component-like protein  29.14 
 
 
341 aa  122  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1653  extracellular solute-binding protein family 1  30.31 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1406  extracellular solute-binding protein family 1  27.92 
 
 
314 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.130817  normal  0.506549 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1216  extracellular solute-binding protein family 1  29.76 
 
 
307 aa  106  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000268953  unclonable  0.0000000000401052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1498  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.76 
 
 
307 aa  106  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00436727  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1022  extracellular solute-binding protein family 1  27.44 
 
 
318 aa  105  9e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2497  tungstate/molybdate binding protein  29.09 
 
 
297 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.102491 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0507  ABC-type molybdate transport system periplasmic component-like protein  29.81 
 
 
393 aa  100  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.701895  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1225  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 
306 aa  97.1  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000686455 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1780  tungstate/molybdate binding protein  28.3 
 
 
366 aa  90.1  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2123  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.55 
 
 
307 aa  85.9  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.04669  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1190  tungstate/molybdate binding protein  25.52 
 
 
296 aa  85.9  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0768198  normal  0.72552 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0707  extracellular solute-binding protein family 1  26.62 
 
 
311 aa  80.1  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2001  extracellular solute-binding protein family 1  23.3 
 
 
402 aa  76.6  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0010  ABC-type molybdate transport system periplasmic component-like protein  27.02 
 
 
304 aa  75.5  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4504  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.99 
 
 
289 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0793086  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3860  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.99 
 
 
289 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0644367  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3667  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.99 
 
 
264 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341489  normal  0.497229 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3757  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.82 
 
 
265 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0635929 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2236  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  28.38 
 
 
291 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.607578  normal  0.187927 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2220  molybdate ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  25.87 
 
 
275 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.35326  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3228  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.47 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.682348 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1934  tungstate/molybdate binding protein  26.03 
 
 
317 aa  60.1  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0273271  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4885  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.62 
 
 
290 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8652  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 
309 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6804  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.28 
 
 
257 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000025189 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0299  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  29.04 
 
 
266 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1478  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  29.04 
 
 
250 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.310787  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1674  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  29.04 
 
 
277 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0330  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  29.04 
 
 
250 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0867  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  29.04 
 
 
296 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.291111  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3859  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  37.93 
 
 
262 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2848  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  28.62 
 
 
257 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2901  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.48 
 
 
400 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2040  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.1 
 
 
283 aa  53.5  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2564  molybdate ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.31 
 
 
277 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0168  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.44 
 
 
250 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2427  molybdate ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.68 
 
 
277 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0593  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.21 
 
 
354 aa  51.2  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2545  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.14 
 
 
255 aa  50.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.778836  normal  0.889945 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0328  molybdenum ABC transporter, periplasmic binding protein  25 
 
 
255 aa  50.4  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.143655  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2732  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.83 
 
 
248 aa  50.1  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2302  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  29.81 
 
 
255 aa  49.3  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4405  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.74 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.216941  normal  0.212386 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1069  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  36.59 
 
 
252 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1581  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.09 
 
 
249 aa  47.4  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1861  molybdenum ABC transporter, molybdenum-binding protein ModA  34.91 
 
 
261 aa  47  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3483  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  35.35 
 
 
264 aa  47  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0571  molybdenum ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  29.17 
 
 
258 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0512  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  40.28 
 
 
251 aa  46.2  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2538  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  31.9 
 
 
255 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.279543  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3095  molybdate ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  24.53 
 
 
290 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.674583  normal  0.14059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2274  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  34.52 
 
 
274 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.366108  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11885  molybdate-binding lipoprotein modA  34.09 
 
 
261 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.189903 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3965  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  32.95 
 
 
261 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000683458  normal  0.0526206 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3851  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  32.95 
 
 
261 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133197  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3323  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  29.63 
 
 
249 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0748  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.92 
 
 
266 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2559  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  32.26 
 
 
268 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00486814  normal  0.114407 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1824  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.9 
 
 
275 aa  43.5  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.694807  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1254  molybdate transporter periplasmic protein  27.81 
 
 
257 aa  43.1  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.894864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3314  molybdate ABC transporter periplasmic molybdate-binding protein  28.23 
 
 
237 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0287436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>