65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8652 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8652  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 309 aa  613  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1190  tungstate/molybdate binding protein  44.36 
 
 		 296 aa  238  9e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0768198  normal  0.72552 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2240  ABC-type molybdate transport system periplasmic component-like protein  38.34 
 
 		 341 aa  181  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1934  tungstate/molybdate binding protein  30.11 
 
 		 317 aa  102  7e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0273271  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2497  tungstate/molybdate binding protein  32.2 
 
 		 297 aa  96.7  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102491 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0010  ABC-type molybdate transport system periplasmic component-like protein  26.82 
 
 		 304 aa  96.3  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1216  extracellular solute-binding protein family 1  26.94 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000268953  unclonable  0.0000000000401052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1498  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.94 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00436727  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0379  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.961539  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0707  extracellular solute-binding protein family 1  26.48 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2123  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.45 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.04669  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1022  extracellular solute-binding protein family 1  31.13 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0525  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.53 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1653  extracellular solute-binding protein family 1  26.83 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1406  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 314 aa  72.4  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.130817  normal  0.506549 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2354  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.42 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000506174  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0640  extracellular solute-binding protein family 1  26.78 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0178146  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2058  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 316 aa  67  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00930598  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2087  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  28.35 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28403e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1405  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.692378  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2560  molybdenum ABC transporter, solute-binding protein  25.08 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403904  normal  0.205693 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1558  molybdenum ABC transporter, solute-binding protein  25.08 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.455674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1756  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.67 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1880  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2634  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  23.67 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000273776  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2084  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.9 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1094  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  29.05 
 
 		 258 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0925  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  27.46 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2346  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.41 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1019  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.97 
 
 		 347 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.884237  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2304  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.41 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0748  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.04 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2302  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 		 636 aa  54.3  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.319071  normal  0.250502 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1453  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.48 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1225  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 306 aa  52.8  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000686455 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0378  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.97 
 
 		 258 aa  52.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1207  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.22 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1849  ABC-type molybdate transport system, periplasmic component  28.1 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1666  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.27 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0954  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  23.68 
 
 		 330 aa  49.7  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1553  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.21 
 
 		 266 aa  49.7  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0473585  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3319  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.26 
 
 		 252 aa  49.3  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0890  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  31.71 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.356678 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1556  ABC-type molybdate transport system periplasmic component-like protein  28.7 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3425  molybdenum ABC transporter, solute-binding protein  24.39 
 
 		 272 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0881211 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2791  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.62 
 
 		 269 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.263569  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1534  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.51 
 
 		 258 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.133844  hitchhiker  0.00863376 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2474  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.8 
 
 		 260 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1025  tungstate/molybdate binding protein  25.71 
 
 		 328 aa  47  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0403292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0299  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.62 
 
 		 276 aa  46.2  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4560  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.99 
 
 		 279 aa  46.2  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119032  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0782  molybdate-binding periplasmic protein precursor ModA  24.6 
 
 		 244 aa  46.2  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.657467  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2010  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  30.59 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.233291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0210  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.97 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1459  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.08 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.297904  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1470  molybdate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  28.68 
 
 		 349 aa  45.1  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.811914  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1600  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.73 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0979  hypothetical protein  28.83 
 
 		 273 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446553  normal  0.0586642 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0413  molybdenum ABC transporter periplasmic-binding protein  24.17 
 
 		 249 aa  44.3  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.9 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6804  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.04 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000025189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0161  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.81 
 
 		 291 aa  43.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0538042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0410  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.19 
 
 		 296 aa  43.5  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00464746  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1160  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.36 
 
 		 264 aa  42.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000579456  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4405  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.69 
 
 		 259 aa  42.4  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.216941  normal  0.212386 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>