More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2850 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2850  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 388 aa  795    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1880  S-adenosylmethionine synthetase  70.47 
 
 		 387 aa  566  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1332  S-adenosylmethionine synthetase  70.47 
 
 		 389 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000124955  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1928  S-adenosylmethionine synthetase  69.19 
 
 		 389 aa  558  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.10598e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1290  S-adenosylmethionine synthetase  70.47 
 
 		 389 aa  560  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000134106  hitchhiker  0.0000021958 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1341  S-adenosylmethionine synthetase  70.73 
 
 		 389 aa  560  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000125757  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2943  S-adenosylmethionine synthetase  70.73 
 
 		 389 aa  560  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0044  S-adenosylmethionine synthetase  68.99 
 
 		 388 aa  553  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000084119  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0367  S-adenosylmethionine synthetase  69.45 
 
 		 389 aa  550  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.913598 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0349  S-adenosylmethionine synthetase  67.53 
 
 		 388 aa  547  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000664302  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  66.15 
 
 		 397 aa  529  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  62.72 
 
 		 387 aa  525  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0690  Methionine adenosyltransferase  66.24 
 
 		 389 aa  518  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0374372  hitchhiker  0.00000199833 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  63.36 
 
 		 396 aa  518  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0532  S-adenosylmethionine synthetase  66.24 
 
 		 389 aa  518  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.347962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  64.8 
 
 		 396 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  62.11 
 
 		 389 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  63.5 
 
 		 393 aa  513  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  61.93 
 
 		 403 aa  512  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  61.6 
 
 		 388 aa  514  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  62.53 
 
 		 403 aa  512  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  63.85 
 
 		 395 aa  512  1e-144  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  62.76 
 
 		 384 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  62.76 
 
 		 384 aa  508  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  62.37 
 
 		 399 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  62.37 
 
 		 399 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  62.37 
 
 		 399 aa  509  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  62.37 
 
 		 399 aa  509  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  62.76 
 
 		 384 aa  508  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  62.76 
 
 		 384 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  62.5 
 
 		 384 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  62.76 
 
 		 384 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  62.37 
 
 		 399 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2541  S-adenosylmethionine synthetase  64.06 
 
 		 399 aa  508  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.245618  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  61.93 
 
 		 399 aa  509  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0841  S-adenosylmethionine synthetase  63.54 
 
 		 384 aa  508  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  62.76 
 
 		 384 aa  508  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  62.76 
 
 		 384 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  63.28 
 
 		 384 aa  509  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3347  S-adenosylmethionine synthetase  63.54 
 
 		 384 aa  508  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  62.76 
 
 		 383 aa  510  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  62.37 
 
 		 399 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0843  S-adenosylmethionine synthetase  63.54 
 
 		 384 aa  508  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000750109  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  62.76 
 
 		 384 aa  508  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  62.76 
 
 		 384 aa  508  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  62.76 
 
 		 384 aa  508  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  62.76 
 
 		 384 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  62.5 
 
 		 384 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  61.87 
 
 		 399 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  62.12 
 
 		 399 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3974  S-adenosylmethionine synthetase  63.02 
 
 		 384 aa  507  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  62.12 
 
 		 399 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  62.5 
 
 		 384 aa  506  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  61.94 
 
 		 381 aa  504  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  62.12 
 
 		 399 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  63.31 
 
 		 395 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  61.98 
 
 		 383 aa  503  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0172  S-adenosylmethionine synthetase  66.06 
 
 		 390 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  62.24 
 
 		 383 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  62.24 
 
 		 383 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  61.98 
 
 		 383 aa  504  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  61.22 
 
 		 396 aa  503  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  62.24 
 
 		 383 aa  503  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1256  S-adenosylmethionine synthetase  61.17 
 
 		 395 aa  499  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.247936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  59.95 
 
 		 398 aa  498  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  62.56 
 
 		 396 aa  500  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  59.95 
 
 		 398 aa  498  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  60.61 
 
 		 395 aa  498  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0154  S-adenosylmethionine synthetase  65.54 
 
 		 390 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0143732  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  62.24 
 
 		 383 aa  498  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2300  S-adenosylmethionine synthetase  64.32 
 
 		 389 aa  498  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  60.97 
 
 		 395 aa  501  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2262  S-adenosylmethionine synthetase  60.68 
 
 		 385 aa  498  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  62.24 
 
 		 383 aa  499  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0161  S-adenosylmethionine synthetase  65.54 
 
 		 388 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0053  S-adenosylmethionine synthetase  60.57 
 
 		 393 aa  494  1e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0201  S-adenosylmethionine synthetase  60.31 
 
 		 387 aa  498  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2131  S-adenosylmethionine synthetase  60.82 
 
 		 393 aa  497  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.204435  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  61.2 
 
 		 383 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0159  S-adenosylmethionine synthetase  65.01 
 
 		 389 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  61.2 
 
 		 383 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0156  S-adenosylmethionine synthetase  59.79 
 
 		 387 aa  494  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  61.2 
 
 		 383 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0826  S-adenosylmethionine synthetase  61.2 
 
 		 383 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2760  S-adenosylmethionine synthetase  60.68 
 
 		 383 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  61.17 
 
 		 414 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  60.94 
 
 		 390 aa  488  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1999  S-adenosylmethionine synthetase  60.21 
 
 		 382 aa  489  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5269  S-adenosylmethionine synthetase  60.05 
 
 		 396 aa  490  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.613554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  59.18 
 
 		 396 aa  489  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  60.94 
 
 		 383 aa  490  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  59.8 
 
 		 396 aa  488  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0533  S-adenosylmethionine synthetase  60.93 
 
 		 393 aa  488  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000146797  normal  0.123305 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0385  S-adenosylmethionine synthetase  60.29 
 
 		 406 aa  490  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0873  S-adenosylmethionine synthetase  61.46 
 
 		 383 aa  489  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  59.44 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  59.85 
 
 		 402 aa  489  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2303  S-adenosylmethionine synthetase  63.8 
 
 		 389 aa  487  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  58.59 
 
 		 382 aa  486  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  60.66 
 
 		 405 aa  486  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>