96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1112 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1112  acetyltransferase, GNAT family  100 
 
 
152 aa  318  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000188501  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1330  acetyltransferase  93.42 
 
 
152 aa  301  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1141  GCN5-related N-acetyltransferase  80.92 
 
 
152 aa  264  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.892071  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1595  GCN5-related N-acetyltransferase  53.47 
 
 
157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2770  GCN5-related N-acetyltransferase  53.1 
 
 
150 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0865  GCN5-related N-acetyltransferase  51.03 
 
 
147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0860  GCN5-related N-acetyltransferase  53.1 
 
 
147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0864  GCN5-related N-acetyltransferase  52.41 
 
 
147 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0741  GCN5-related N-acetyltransferase  51.72 
 
 
147 aa  160  6e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0766  GCN5-related N-acetyltransferase  52.45 
 
 
147 aa  160  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3551  GCN5-related N-acetyltransferase  52.45 
 
 
147 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3673  GCN5-related N-acetyltransferase  52.45 
 
 
147 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3482  GCN5-related N-acetyltransferase  52.45 
 
 
147 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3174  GCN5-related N-acetyltransferase  51.02 
 
 
149 aa  159  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.524081  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0920  acetyltransferase  52.45 
 
 
147 aa  158  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0762  GCN5-related N-acetyltransferase  51.72 
 
 
147 aa  158  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3364  GCN5-related N-acetyltransferase  51.03 
 
 
147 aa  157  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3261  GCN5-related N-acetyltransferase  51.03 
 
 
147 aa  157  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0862  GCN5-related N-acetyltransferase  51.72 
 
 
147 aa  157  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0773  GCN5-related N-acetyltransferase  51.72 
 
 
147 aa  156  9e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4218  GCN5-related N-acetyltransferase  42.57 
 
 
166 aa  135  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.530499  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1677  GCN5-related N-acetyltransferase  40.13 
 
 
152 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33160  acetyltransferase (GNAT) family protein  33.09 
 
 
143 aa  59.7  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0204184  normal  0.66835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  26.85 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.0183751 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1314  GCN5-related N-acetyltransferase  26.62 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2096  GCN5-related N-acetyltransferase  24.5 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  21.83 
 
 
212 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377993  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0650  hypothetical protein  30.28 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  28.85 
 
 
150 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.675647  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0312  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
168 aa  50.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.648752  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2124  GCN5-related N-acetyltransferase  27.94 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160054  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2132  diamine acetyltransferase  31.67 
 
 
178 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105649  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0882  GCN5-related N-acetyltransferase  26.95 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.922841 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1911  acetyltransferase  27.82 
 
 
363 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0895  hypothetical protein  23.45 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1199  GCN5-related N-acetyltransferase  29.5 
 
 
164 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2450  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 
159 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0602  GCN5-related N-acetyltransferase  28.7 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.047799 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02661  putative N-acetyltransferase  29.94 
 
 
162 aa  46.2  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.967011  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3984  GCN5-like N-acetyltransferase  32.29 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2855  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
173 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30670  sortase-like acyltransferase  27.68 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479101  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3246  GCN5-related N-acetyltransferase  26.05 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000002184  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2615  GCN5-related N-acetyltransferase  39.66 
 
 
160 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1051  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
169 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0453046 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1055  hypothetical protein  24.66 
 
 
153 aa  44.7  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3005  acetyltransferase, GNAT family  39.66 
 
 
160 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1728  GCN5-related N-acetyltransferase  26.61 
 
 
188 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000677629 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1564  GCN5-related N-acetyltransferase  28.37 
 
 
179 aa  44.3  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684291  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0591  GCN5-related N-acetyltransferase  31.69 
 
 
171 aa  44.3  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6158  GCN5-related N-acetyltransferase  31.87 
 
 
158 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0997895  normal  0.166229 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1393  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
168 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.232677  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0284  GCN5-related N-acetyltransferase  31.31 
 
 
171 aa  43.9  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00100588  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0289  GCN5-related N-acetyltransferase  31.31 
 
 
171 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000757903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8955  GCN5-related N-acetyltransferase  31.87 
 
 
149 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316423  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  32.97 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06300  GNAT family acetyltransferase  36.84 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128549  normal  0.32905 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3784  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
162 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.316492  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1241  GCN5-related N-acetyltransferase  28.06 
 
 
162 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.595226 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0119  acetyltransferase  26.32 
 
 
152 aa  43.9  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0586  putative acetyltransferase  35.09 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0321507  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1971  GCN5-related N-acetyltransferase  24.77 
 
 
226 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.308941  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4039  GCN5-related N-acetyltransferase  32.63 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.880939  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  27.17 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4022  GCN5-related N-acetyltransferase  29.61 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0646  acetyltransferase, gnat family  24.05 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.46406  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2042  GCN5-related N-acetyltransferase  31.11 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236915  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5735  GCN5-related N-acetyltransferase  25.53 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77189  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0802  putative acetyltransferase  28.91 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  25.68 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00150599  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0265  GCN5-related N-acetyltransferase  30.11 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2724  GCN5-related N-acetyltransferase  28.91 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.33727  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6099  putative acetyltransferase family protein  30.36 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29421  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2318  GCN5-related N-acetyltransferase  25.68 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253918  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2000  GCN5-related N-acetyltransferase  32.69 
 
 
162 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.744439  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2540  GCN5-related N-acetyltransferase  28.99 
 
 
159 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777279 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0612  GCN5-related N-acetyltransferase  24.03 
 
 
183 aa  42.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.56302  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4148  GCN5-related N-acetyltransferase  26.24 
 
 
173 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.674163 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0526  GCN5-related N-acetyltransferase  28.15 
 
 
170 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0005  GCN5-related N-acetyltransferase  26.24 
 
 
173 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1786  GCN5-related N-acetyltransferase  27.1 
 
 
162 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.823554 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1473  putative acetyltransferase  27.84 
 
 
166 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2820  acetyltransferase, gnat family  29.33 
 
 
186 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115026  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5816  acetyltransferase  27.01 
 
 
160 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294644  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2677  GCN5-related N-acetyltransferase  26.89 
 
 
161 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.245575  normal  0.057406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2356  GCN5-related N-acetyltransferase  28.99 
 
 
159 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3406  acetyltransferase  28.26 
 
 
159 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.344947 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4207  GCN5-related N-acetyltransferase  31.96 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0886  acetyltransferase  30.26 
 
 
165 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0418  acetyltransferase  24.49 
 
 
184 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0657723 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0549  GCN5-related N-acetyltransferase  31.15 
 
 
146 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0976  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
170 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3628  GCN5-related N-acetyltransferase  31.91 
 
 
155 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.169906  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0214  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 
162 aa  40.4  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.159498 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1275  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
163 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308513  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1057  GCN5-related N-acetyltransferase  25.37 
 
 
149 aa  40.4  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>