102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0860 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_0860  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
147 aa  303  7e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0773  GCN5-related N-acetyltransferase  85.71 
 
 
147 aa  261  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0762  GCN5-related N-acetyltransferase  82.99 
 
 
147 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3261  GCN5-related N-acetyltransferase  82.31 
 
 
147 aa  251  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3364  GCN5-related N-acetyltransferase  82.31 
 
 
147 aa  251  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0920  acetyltransferase  82.31 
 
 
147 aa  251  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0865  GCN5-related N-acetyltransferase  80.95 
 
 
147 aa  249  9.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0741  GCN5-related N-acetyltransferase  80.27 
 
 
147 aa  246  5e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0766  GCN5-related N-acetyltransferase  79.59 
 
 
147 aa  243  6e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3551  GCN5-related N-acetyltransferase  79.59 
 
 
147 aa  243  9e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3673  GCN5-related N-acetyltransferase  79.59 
 
 
147 aa  243  9e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3482  GCN5-related N-acetyltransferase  79.59 
 
 
147 aa  243  9e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0862  GCN5-related N-acetyltransferase  78.23 
 
 
147 aa  241  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0864  GCN5-related N-acetyltransferase  77.55 
 
 
147 aa  239  7.999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3174  GCN5-related N-acetyltransferase  75.34 
 
 
149 aa  238  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.524081  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2770  GCN5-related N-acetyltransferase  74.15 
 
 
150 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1595  GCN5-related N-acetyltransferase  55.86 
 
 
157 aa  173  6e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1141  GCN5-related N-acetyltransferase  53.1 
 
 
152 aa  165  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.892071  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1112  acetyltransferase, GNAT family  53.1 
 
 
152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000188501  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1330  acetyltransferase  52.41 
 
 
152 aa  160  6e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4218  GCN5-related N-acetyltransferase  45.52 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.530499  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1677  GCN5-related N-acetyltransferase  31.94 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  29.25 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.0183751 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1055  hypothetical protein  25 
 
 
153 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  23.24 
 
 
212 aa  54.3  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377993  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  24.83 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.315847  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0054  acetyltransferase  27.74 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33160  acetyltransferase (GNAT) family protein  27.34 
 
 
143 aa  50.8  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0204184  normal  0.66835 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6430  GCN5-related N-acetyltransferase  30.09 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.982998 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1314  GCN5-related N-acetyltransferase  23.02 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0549  GCN5-related N-acetyltransferase  28.21 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0612  GCN5-related N-acetyltransferase  24.83 
 
 
183 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.56302  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0976  GCN5-related N-acetyltransferase  25.68 
 
 
170 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.06 
 
 
148 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.967932  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0611  acetyltransferase  23.45 
 
 
155 aa  47.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17770  acetyltransferase  39.53 
 
 
157 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.356632 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0650  hypothetical protein  26.81 
 
 
161 aa  47  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07340  predicted acyltransferase  38.98 
 
 
161 aa  47  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.633713  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0895  hypothetical protein  24.09 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2077  GCN5-related N-acetyltransferase  21.23 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221334  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0874  GCN5-related N-acetyltransferase  27.61 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  23.45 
 
 
159 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5735  GCN5-related N-acetyltransferase  25.5 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77189  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4148  GCN5-related N-acetyltransferase  25.5 
 
 
173 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.674163 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1239  GCN5-related N-acetyltransferase  21.48 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3724  GCN5-related N-acetyltransferase  25.52 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0005  GCN5-related N-acetyltransferase  25.5 
 
 
173 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30670  sortase-like acyltransferase  27.41 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479101  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1685  GCN5-related N-acetyltransferase  27.74 
 
 
277 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0171402  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0882  GCN5-related N-acetyltransferase  24.16 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.922841 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1154  histone acetyltransferase  30.1 
 
 
153 aa  44.3  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2905  GCN5-related N-acetyltransferase  26.79 
 
 
131 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02661  putative N-acetyltransferase  26.17 
 
 
162 aa  44.3  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.967011  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2579  GCN5-related N-acetyltransferase  25.74 
 
 
147 aa  44.3  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107759  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06300  GNAT family acetyltransferase  25.35 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128549  normal  0.32905 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06850  acetyltransferase  30.19 
 
 
154 aa  43.9  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2000  GCN5-related N-acetyltransferase  30.2 
 
 
162 aa  43.9  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.744439  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3210  aminoglycoside N6'-acetyltransferase  26.55 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.938022  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2689  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 
151 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2124  GCN5-related N-acetyltransferase  27.94 
 
 
159 aa  43.5  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160054  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2923  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 
150 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.972498  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0036  GCN5-related N-acetyltransferase  25.5 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  24.16 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00150599  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  26.61 
 
 
150 aa  42.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0683  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000012608  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2412  GCN5-related N-acetyltransferase  25.49 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700134 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2318  GCN5-related N-acetyltransferase  24.16 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253918  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2615  GCN5-related N-acetyltransferase  27.52 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3005  acetyltransferase, GNAT family  27.52 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1816  putative transmembrane protein  26.47 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3286  acetyltransferase  28.68 
 
 
149 aa  42  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.867207 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1503  GCN5-related N-acetyltransferase  31.63 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.528782 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0436  acetyltransferase  25.37 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3849  GCN5-related N-acetyltransferase  29.09 
 
 
414 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156281  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4519  GCN5-related N-acetyltransferase  29.09 
 
 
414 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0586  putative acetyltransferase  24.65 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0321507  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3791  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00503976  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5785  GCN5-related N-acetyltransferase  29.36 
 
 
400 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316473  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1329  GCN5-related N-acetyltransferase  29.09 
 
 
414 aa  41.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0797  GCN5-related N-acetyltransferase  30.95 
 
 
157 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.64156  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2855  GCN5-related N-acetyltransferase  30.59 
 
 
173 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0052  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
149 aa  41.6  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
133 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2899  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.21 
 
 
168 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256111  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0813  putative acetyltransferase  28 
 
 
161 aa  41.2  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.425962  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0549  putative acetyltransferase  32.63 
 
 
141 aa  41.2  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0385  phosphinothricin acetyltransferase (PPT N-acetyltransferase)  25.35 
 
 
176 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0414  GCN5-related N-acetyltransferase  24.29 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.808997 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0615  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.67 
 
 
165 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.417084 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0886  acetyltransferase  28.72 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2408  GCN5-related N-acetyltransferase  24.84 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0178488  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0359  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
183 aa  41.2  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.605225  normal  0.0824399 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4374  GCN5-related N-acetyltransferase  26.47 
 
 
222 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2018  GCN5-related N-acetyltransferase  28.87 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406329  normal  0.262902 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1971  GCN5-related N-acetyltransferase  29 
 
 
226 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.308941  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1313  putative acetyltransferase  32.18 
 
 
163 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.338207  normal  0.391581 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  24.84 
 
 
195 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2063  GCN5-related N-acetyltransferase  28.1 
 
 
158 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000236474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6596  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
286 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.214759  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  25.51 
 
 
150 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.675647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>