105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0920 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0920  acetyltransferase  100 
 
 
147 aa  301  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3261  GCN5-related N-acetyltransferase  96.6 
 
 
147 aa  295  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3364  GCN5-related N-acetyltransferase  96.6 
 
 
147 aa  295  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0762  GCN5-related N-acetyltransferase  96.6 
 
 
147 aa  293  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0766  GCN5-related N-acetyltransferase  92.52 
 
 
147 aa  280  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3551  GCN5-related N-acetyltransferase  91.84 
 
 
147 aa  278  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3673  GCN5-related N-acetyltransferase  91.84 
 
 
147 aa  278  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3482  GCN5-related N-acetyltransferase  91.84 
 
 
147 aa  278  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0862  GCN5-related N-acetyltransferase  90.48 
 
 
147 aa  276  9e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0860  GCN5-related N-acetyltransferase  82.31 
 
 
147 aa  251  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0773  GCN5-related N-acetyltransferase  78.91 
 
 
147 aa  247  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0865  GCN5-related N-acetyltransferase  78.23 
 
 
147 aa  244  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0741  GCN5-related N-acetyltransferase  80.27 
 
 
147 aa  243  9e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2770  GCN5-related N-acetyltransferase  74.83 
 
 
150 aa  231  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3174  GCN5-related N-acetyltransferase  70.75 
 
 
149 aa  221  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.524081  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0864  GCN5-related N-acetyltransferase  74.15 
 
 
147 aa  220  4e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1595  GCN5-related N-acetyltransferase  58.9 
 
 
157 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1141  GCN5-related N-acetyltransferase  51.72 
 
 
152 aa  161  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.892071  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1330  acetyltransferase  52.41 
 
 
152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1112  acetyltransferase, GNAT family  52.45 
 
 
152 aa  158  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000188501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4218  GCN5-related N-acetyltransferase  44.83 
 
 
166 aa  134  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.530499  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1677  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  27.89 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.0183751 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1055  hypothetical protein  26.76 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1239  GCN5-related N-acetyltransferase  29.82 
 
 
153 aa  52.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4357  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
153 aa  52  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.315847  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33160  acetyltransferase (GNAT) family protein  27.34 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0204184  normal  0.66835 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0895  hypothetical protein  23.91 
 
 
151 aa  52  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2077  GCN5-related N-acetyltransferase  24.84 
 
 
155 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221334  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0310  GCN5-related N-acetyltransferase  25.42 
 
 
154 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132707  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0437  GCN5-related N-acetyltransferase  27.03 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.195322  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0612  GCN5-related N-acetyltransferase  27.52 
 
 
183 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.56302  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17770  acetyltransferase  40.7 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.356632 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2000  GCN5-related N-acetyltransferase  28.86 
 
 
162 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.744439  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0054  acetyltransferase  26.76 
 
 
152 aa  47.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3791  GCN5-related N-acetyltransferase  29.67 
 
 
168 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00503976  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  22.54 
 
 
212 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377993  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3724  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0999  acetyltransferase  27.7 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0121067  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0036  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 
154 aa  47.4  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3689  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
156 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.950669  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1640  acetyltransferase  26.67 
 
 
150 aa  47  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0611  acetyltransferase  25.52 
 
 
155 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1314  GCN5-related N-acetyltransferase  22.63 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0436  acetyltransferase  26.67 
 
 
153 aa  45.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2905  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
131 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3462  putative acetyltransferase  33.33 
 
 
141 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2412  GCN5-related N-acetyltransferase  25.85 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700134 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6430  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.982998 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  23.7 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05970  acetyltransferase  24.82 
 
 
174 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.410057  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1464  GCN5-related N-acetyltransferase  25.9 
 
 
166 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.975468  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4148  GCN5-related N-acetyltransferase  25.5 
 
 
173 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.674163 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0029  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.79 
 
 
176 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0874  GCN5-related N-acetyltransferase  27.46 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0005  GCN5-related N-acetyltransferase  25.5 
 
 
173 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4374  GCN5-related N-acetyltransferase  28.68 
 
 
222 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0976  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 
170 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0882  GCN5-related N-acetyltransferase  25.17 
 
 
165 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.922841 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  24.29 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.675647  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2615  GCN5-related N-acetyltransferase  26.79 
 
 
160 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3005  acetyltransferase, GNAT family  26.79 
 
 
160 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2408  GCN5-related N-acetyltransferase  25.17 
 
 
165 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0178488  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2689  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 
151 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  25.17 
 
 
195 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2879  GCN5-related N-acetyltransferase  23.13 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.231437  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  27.52 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5735  GCN5-related N-acetyltransferase  25.85 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77189  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0094  GCN5-related N-acetyltransferase  32.95 
 
 
180 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22184  normal  0.0577704 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2018  GCN5-related N-acetyltransferase  27.84 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406329  normal  0.262902 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2196  GCN5-related N-acetyltransferase  26.62 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000283618  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3210  putative acetyltransferase  33.7 
 
 
141 aa  42  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0615  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.417084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8909  putative acetyltransferase  28.89 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  24.49 
 
 
165 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00150599  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1034  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28 
 
 
371 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1751  GCN5-related N-acetyltransferase  26.04 
 
 
155 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1971  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 
226 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.308941  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2318  GCN5-related N-acetyltransferase  24.49 
 
 
165 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253918  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1343  GCN5-related N-acetyltransferase  22.82 
 
 
153 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0602  GCN5-related N-acetyltransferase  24.63 
 
 
168 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.047799 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0969  GCN5-related N-acetyltransferase  26.53 
 
 
150 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0028  GCN5-related N-acetyltransferase  30.2 
 
 
157 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7546  putative acetyltransferase protein  23.19 
 
 
160 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0485  GCN5-related N-acetyltransferase  25.34 
 
 
136 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535173  normal  0.634598 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0359  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
183 aa  41.6  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.605225  normal  0.0824399 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2124  GCN5-related N-acetyltransferase  25.9 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160054  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3984  GCN5-like N-acetyltransferase  26.28 
 
 
163 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.631639  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2855  GCN5-related N-acetyltransferase  30.59 
 
 
173 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.82 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.967932  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3289  putative acetyltransferase  31.52 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.834546  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0549  GCN5-related N-acetyltransferase  27.68 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04197  N-acetyltransferase  23.7 
 
 
163 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3427  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
151 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1564  GCN5-related N-acetyltransferase  25.93 
 
 
179 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684291  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3002  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533457  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0586  putative acetyltransferase  23.94 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0321507  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2063  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
158 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000236474 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>