56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1595 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_1595  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
157 aa  324  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0864  GCN5-related N-acetyltransferase  61.38 
 
 
147 aa  189  9e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0773  GCN5-related N-acetyltransferase  58.22 
 
 
147 aa  184  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2770  GCN5-related N-acetyltransferase  58.62 
 
 
150 aa  183  9e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0920  acetyltransferase  58.9 
 
 
147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0862  GCN5-related N-acetyltransferase  58.22 
 
 
147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3551  GCN5-related N-acetyltransferase  58.22 
 
 
147 aa  181  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3673  GCN5-related N-acetyltransferase  58.22 
 
 
147 aa  181  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3482  GCN5-related N-acetyltransferase  58.22 
 
 
147 aa  181  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0766  GCN5-related N-acetyltransferase  58.22 
 
 
147 aa  181  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0762  GCN5-related N-acetyltransferase  58.22 
 
 
147 aa  180  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3261  GCN5-related N-acetyltransferase  58.22 
 
 
147 aa  180  6e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3364  GCN5-related N-acetyltransferase  58.22 
 
 
147 aa  180  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0741  GCN5-related N-acetyltransferase  57.93 
 
 
147 aa  176  9e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0865  GCN5-related N-acetyltransferase  56.55 
 
 
147 aa  176  9e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3174  GCN5-related N-acetyltransferase  55.94 
 
 
149 aa  174  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.524081  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0860  GCN5-related N-acetyltransferase  55.86 
 
 
147 aa  173  8e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1141  GCN5-related N-acetyltransferase  52.78 
 
 
152 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.892071  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1112  acetyltransferase, GNAT family  53.47 
 
 
152 aa  171  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000188501  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1330  acetyltransferase  52.45 
 
 
152 aa  169  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4218  GCN5-related N-acetyltransferase  42.07 
 
 
166 aa  123  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.530499  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1677  GCN5-related N-acetyltransferase  35.62 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
151 aa  58.2  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.0183751 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06300  GNAT family acetyltransferase  25.18 
 
 
147 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128549  normal  0.32905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0586  putative acetyltransferase  24.46 
 
 
147 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0321507  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  22.54 
 
 
212 aa  48.9  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377993  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1314  GCN5-related N-acetyltransferase  24.77 
 
 
148 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2096  GCN5-related N-acetyltransferase  23.38 
 
 
148 aa  47.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0119  acetyltransferase  26.32 
 
 
152 aa  47.8  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0882  GCN5-related N-acetyltransferase  25.36 
 
 
165 aa  47  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.922841 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2855  GCN5-related N-acetyltransferase  30.23 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  24.09 
 
 
150 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.675647  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1055  hypothetical protein  25 
 
 
153 aa  44.7  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0436  acetyltransferase  27.34 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1551  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
172 aa  44.3  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000065475  hitchhiker  0.000144401 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3300  GCN5-related N-acetyltransferase  27.03 
 
 
175 aa  43.9  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0928337  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0240  GCN5-related N-acetyltransferase  33.73 
 
 
155 aa  43.9  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33160  acetyltransferase (GNAT) family protein  26.21 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0204184  normal  0.66835 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0895  hypothetical protein  19.26 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2879  GCN5-related N-acetyltransferase  25.19 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.231437  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0650  hypothetical protein  24.19 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0025  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.22 
 
 
176 aa  43.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0146128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2497  hypothetical protein  28.28 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.468005  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1971  GCN5-related N-acetyltransferase  29.81 
 
 
226 aa  42.4  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.308941  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1507  GCN5-related N-acetyltransferase  31.34 
 
 
210 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  25.76 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.315847  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0602  GCN5-related N-acetyltransferase  26.85 
 
 
168 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.047799 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1500  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
184 aa  41.6  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1241  GCN5-related N-acetyltransferase  24.56 
 
 
162 aa  41.2  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.595226 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2000  GCN5-related N-acetyltransferase  26.85 
 
 
162 aa  41.2  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.744439  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0874  GCN5-related N-acetyltransferase  22.73 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2318  GCN5-related N-acetyltransferase  23.91 
 
 
165 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253918  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  23.91 
 
 
165 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00150599  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1053  GCN5-related N-acetyltransferase  27.03 
 
 
153 aa  40.4  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.246804  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3246  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 
147 aa  40.4  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000002184  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1528  GCN5-related N-acetyltransferase  25.96 
 
 
154 aa  40.4  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>