132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3174 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_3174  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
149 aa  309  9e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.524081  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0864  GCN5-related N-acetyltransferase  77.55 
 
 
147 aa  241  1.9999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0773  GCN5-related N-acetyltransferase  76.71 
 
 
147 aa  239  9e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0860  GCN5-related N-acetyltransferase  75.34 
 
 
147 aa  238  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0741  GCN5-related N-acetyltransferase  74.83 
 
 
147 aa  227  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0762  GCN5-related N-acetyltransferase  72.11 
 
 
147 aa  223  6e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3261  GCN5-related N-acetyltransferase  71.43 
 
 
147 aa  223  8e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3364  GCN5-related N-acetyltransferase  71.43 
 
 
147 aa  223  8e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0865  GCN5-related N-acetyltransferase  71.92 
 
 
147 aa  222  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0920  acetyltransferase  70.75 
 
 
147 aa  221  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0862  GCN5-related N-acetyltransferase  71.43 
 
 
147 aa  221  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2770  GCN5-related N-acetyltransferase  69.13 
 
 
150 aa  221  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0766  GCN5-related N-acetyltransferase  71.43 
 
 
147 aa  221  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3551  GCN5-related N-acetyltransferase  71.43 
 
 
147 aa  221  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3673  GCN5-related N-acetyltransferase  71.43 
 
 
147 aa  221  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3482  GCN5-related N-acetyltransferase  71.43 
 
 
147 aa  221  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1595  GCN5-related N-acetyltransferase  55.94 
 
 
157 aa  174  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1141  GCN5-related N-acetyltransferase  51.7 
 
 
152 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.892071  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1112  acetyltransferase, GNAT family  51.02 
 
 
152 aa  159  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000188501  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1330  acetyltransferase  51.03 
 
 
152 aa  156  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4218  GCN5-related N-acetyltransferase  45.21 
 
 
166 aa  138  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.530499  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1677  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 
152 aa  101  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  26.53 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.0183751 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  24.48 
 
 
212 aa  60.5  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377993  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  25.68 
 
 
153 aa  55.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.315847  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33160  acetyltransferase (GNAT) family protein  29.5 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0204184  normal  0.66835 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0436  acetyltransferase  29.1 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0612  GCN5-related N-acetyltransferase  25.32 
 
 
183 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.56302  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8909  putative acetyltransferase  32.12 
 
 
139 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1314  GCN5-related N-acetyltransferase  22.3 
 
 
148 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1239  GCN5-related N-acetyltransferase  27.62 
 
 
153 aa  50.4  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1055  hypothetical protein  23.24 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5735  GCN5-related N-acetyltransferase  29.05 
 
 
165 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77189  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2412  GCN5-related N-acetyltransferase  29.05 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700134 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3784  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.316492  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  25.33 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1640  acetyltransferase  34.74 
 
 
150 aa  47.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  27.7 
 
 
165 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00150599  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2318  GCN5-related N-acetyltransferase  27.7 
 
 
165 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253918  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0025  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.62 
 
 
176 aa  47.4  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0146128 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2408  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
165 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0178488  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
195 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0615  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.07 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.417084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2905  GCN5-related N-acetyltransferase  26.5 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3462  putative acetyltransferase  37 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2955  putative acetyltransferase  35.11 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68791  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1241  GCN5-related N-acetyltransferase  28.78 
 
 
162 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.595226 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.77 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.967932  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2689  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2643  putative acetyltransferase  36.17 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2709  putative acetyltransferase  36.17 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2685  putative acetyltransferase  36.17 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.440261  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2594  putative acetyltransferase  36.17 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2815  putative acetyltransferase  36.17 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.438827  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3286  acetyltransferase  28.68 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.867207 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2096  GCN5-related N-acetyltransferase  19.59 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0886  acetyltransferase  29.79 
 
 
165 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07340  predicted acyltransferase  32.95 
 
 
161 aa  44.7  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.633713  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0882  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 
165 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.922841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3005  acetyltransferase, GNAT family  29.36 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0731  GCN5-related N-acetyltransferase  22.68 
 
 
159 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2615  GCN5-related N-acetyltransferase  29.36 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02334  putative acetyltransferase  34.04 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1022  GCN5-related N-acetyltransferase  23.71 
 
 
159 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288389  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02296  hypothetical protein  34.04 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2571  putative acetyltransferase  34.04 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2720  putative acetyltransferase  34.04 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2589  putative acetyltransferase  34.04 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2806  putative acetyltransferase  34.04 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3664  putative acetyltransferase  34.04 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.863704  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0178  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 
154 aa  43.9  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.502613  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0758  putative acetyltransferase  31.88 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5667  GCN5-related N-acetyltransferase  32.61 
 
 
190 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0359  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.33 
 
 
183 aa  43.5  0.0009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.605225  normal  0.0824399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1079  acetyltransferase  26.67 
 
 
153 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1227  GCN5-related N-acetyltransferase  32.98 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  29.21 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4993  GCN5-related N-acetyltransferase  27.45 
 
 
153 aa  42.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0650  hypothetical protein  27.74 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1957  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  28.89 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2497  GCN5-related N-acetyltransferase  28.04 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12144  normal  0.087022 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3827  GCN5-related N-acetyltransferase  25.74 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2855  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1245  putative acetyltransferase  32.98 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.756848 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4357  GCN5-related N-acetyltransferase  25.69 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1494  putative acetyltransferase  35.11 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.190501  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3210  aminoglycoside N6'-acetyltransferase  28.57 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.938022  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2631  GCN5-related N-acetyltransferase  27.05 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.512633  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1685  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 
277 aa  42  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0171402  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1911  acetyltransferase  23.61 
 
 
363 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0554  conserved hypothetical protein, putative acetyltransferase (GNAT family)  22.77 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3724  GCN5-related N-acetyltransferase  25.34 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14360  acetyltransferase  37.29 
 
 
188 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.197126  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1971  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
226 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.308941  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0602  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.047799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0052  GCN5-related N-acetyltransferase  27.74 
 
 
149 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2077  GCN5-related N-acetyltransferase  20 
 
 
155 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221334  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30670  sortase-like acyltransferase  32.56 
 
 
161 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479101  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11750  acetyltransferase  27.18 
 
 
153 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.292363  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0523  GCN5-related N-acetyltransferase  34 
 
 
182 aa  41.6  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142872  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>