More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2287 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2287  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 390 aa  807    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000191933  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1496  S-adenosylmethionine synthetase  82.38 
 
 		 391 aa  658    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000460029  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0786  S-adenosylmethionine synthetase  85.05 
 
 		 391 aa  672    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.250951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2941  S-adenosylmethionine synthetase  81.14 
 
 		 389 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156862 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2303  S-adenosylmethionine synthetase  72.66 
 
 		 389 aa  560  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2300  S-adenosylmethionine synthetase  71.43 
 
 		 389 aa  555  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1290  S-adenosylmethionine synthetase  63.99 
 
 		 389 aa  497  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000134106  hitchhiker  0.0000021958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1880  S-adenosylmethionine synthetase  63.21 
 
 		 387 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0349  S-adenosylmethionine synthetase  63.38 
 
 		 388 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000664302  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2943  S-adenosylmethionine synthetase  62.5 
 
 		 389 aa  488  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  60 
 
 		 383 aa  488  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  60.21 
 
 		 387 aa  489  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1341  S-adenosylmethionine synthetase  62.5 
 
 		 389 aa  488  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000125757  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1332  S-adenosylmethionine synthetase  61.92 
 
 		 389 aa  487  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000124955  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0044  S-adenosylmethionine synthetase  62.6 
 
 		 388 aa  485  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000084119  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  60.31 
 
 		 384 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  59.22 
 
 		 383 aa  481  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  61.52 
 
 		 390 aa  483  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  60.57 
 
 		 384 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3347  S-adenosylmethionine synthetase  60.84 
 
 		 384 aa  483  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1928  S-adenosylmethionine synthetase  62.24 
 
 		 389 aa  483  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.10598e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  60.31 
 
 		 384 aa  483  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0843  S-adenosylmethionine synthetase  60.84 
 
 		 384 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000750109  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  60.57 
 
 		 384 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  59.79 
 
 		 383 aa  482  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  59.79 
 
 		 383 aa  482  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  59.27 
 
 		 383 aa  483  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0841  S-adenosylmethionine synthetase  60.84 
 
 		 384 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  60.57 
 
 		 384 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  59.79 
 
 		 383 aa  482  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3974  S-adenosylmethionine synthetase  60.31 
 
 		 384 aa  482  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  60.31 
 
 		 384 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  60.31 
 
 		 384 aa  481  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1256  S-adenosylmethionine synthetase  59.03 
 
 		 395 aa  481  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.247936  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  60.31 
 
 		 384 aa  481  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  60.31 
 
 		 384 aa  481  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  59.27 
 
 		 383 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  59.27 
 
 		 383 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  58.96 
 
 		 383 aa  479  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  60.31 
 
 		 384 aa  481  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  60.31 
 
 		 384 aa  481  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  59.27 
 
 		 383 aa  479  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0532  S-adenosylmethionine synthetase  62.76 
 
 		 389 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.347962  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0690  Methionine adenosyltransferase  62.76 
 
 		 389 aa  479  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0374372  hitchhiker  0.00000199833 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  60.31 
 
 		 384 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  60.31 
 
 		 384 aa  480  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  59.27 
 
 		 383 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  59.01 
 
 		 383 aa  479  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  60.31 
 
 		 384 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  60.31 
 
 		 384 aa  481  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  59.69 
 
 		 389 aa  476  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  59.64 
 
 		 388 aa  474  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0826  S-adenosylmethionine synthetase  59.27 
 
 		 383 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1821  S-adenosylmethionine synthetase  58.95 
 
 		 385 aa  477  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0267535  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0454  S-adenosylmethionine synthetase  59.08 
 
 		 396 aa  475  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2760  S-adenosylmethionine synthetase  58.95 
 
 		 383 aa  475  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1864  S-adenosylmethionine synthetase  59.49 
 
 		 399 aa  475  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2678  S-adenosylmethionine synthetase  60.89 
 
 		 403 aa  473  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.257721  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0873  S-adenosylmethionine synthetase  58.44 
 
 		 383 aa  474  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1857  S-adenosylmethionine synthetase  59.75 
 
 		 399 aa  474  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0367  S-adenosylmethionine synthetase  58.66 
 
 		 389 aa  473  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.913598 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1179  Methionine adenosyltransferase  59.27 
 
 		 389 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2541  S-adenosylmethionine synthetase  60.98 
 
 		 399 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.245618  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2850  S-adenosylmethionine synthetase  61.14 
 
 		 388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  58.53 
 
 		 381 aa  471  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0787  S-adenosylmethionine synthetase  57.81 
 
 		 384 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.451532  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  57.22 
 
 		 396 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3227  S-adenosylmethionine synthetase  58.27 
 
 		 382 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.359365 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0499  S-adenosylmethionine synthetase  58.82 
 
 		 396 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4967  S-adenosylmethionine synthetase  58.57 
 
 		 396 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  55.53 
 
 		 403 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  58.63 
 
 		 396 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0201  S-adenosylmethionine synthetase  58.85 
 
 		 387 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5269  S-adenosylmethionine synthetase  58.31 
 
 		 396 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.613554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  57.43 
 
 		 398 aa  467  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  58.47 
 
 		 382 aa  468  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0875  S-adenosylmethionine synthetase  57.29 
 
 		 384 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0156  S-adenosylmethionine synthetase  59.38 
 
 		 387 aa  465  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5016  S-adenosylmethionine synthetase  58.57 
 
 		 396 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330289 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  57.43 
 
 		 398 aa  467  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4840  S-adenosylmethionine synthetase  58.57 
 
 		 396 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.905564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002467  S-adenosylmethionine synthetase  59.07 
 
 		 384 aa  464  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.508872  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0024  S-adenosylmethionine synthetase  59.27 
 
 		 385 aa  462  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  57.29 
 
 		 402 aa  462  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  56.28 
 
 		 399 aa  462  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3905  S-adenosylmethionine synthetase  59.9 
 
 		 406 aa  464  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000687531  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0506  S-adenosylmethionine synthetase  59.64 
 
 		 384 aa  463  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000508675  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1771  S-adenosylmethionine synthetase  57.11 
 
 		 403 aa  462  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0172  S-adenosylmethionine synthetase  62.27 
 
 		 390 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2894  S-adenosylmethionine synthetase  58.99 
 
 		 391 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  56.6 
 
 		 395 aa  461  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03568  S-adenosylmethionine synthetase  58.81 
 
 		 384 aa  461  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3161  S-adenosylmethionine synthetase  59.14 
 
 		 396 aa  462  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153387  hitchhiker  0.00000474907 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  56.96 
 
 		 396 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1840  S-adenosylmethionine synthetase  56.86 
 
 		 403 aa  462  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0161  S-adenosylmethionine synthetase  62.57 
 
 		 388 aa  461  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2262  S-adenosylmethionine synthetase  58.22 
 
 		 385 aa  462  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  57.65 
 
 		 396 aa  461  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3707  S-adenosylmethionine synthetase  59.9 
 
 		 383 aa  463  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00568587  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0383  S-adenosylmethionine synthetase  58.27 
 
 		 396 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>