More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0786 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1496  S-adenosylmethionine synthetase  83.59 
 
 		 391 aa  675    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000460029  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2287  S-adenosylmethionine synthetase  85.05 
 
 		 390 aa  671    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000191933  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0786  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 391 aa  810    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.250951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2941  S-adenosylmethionine synthetase  83.12 
 
 		 389 aa  630  1e-179  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156862 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2303  S-adenosylmethionine synthetase  72.63 
 
 		 389 aa  555  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2300  S-adenosylmethionine synthetase  70.33 
 
 		 389 aa  548  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1290  S-adenosylmethionine synthetase  64.51 
 
 		 389 aa  497  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000134106  hitchhiker  0.0000021958 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1341  S-adenosylmethionine synthetase  64.32 
 
 		 389 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000125757  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2943  S-adenosylmethionine synthetase  64.32 
 
 		 389 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  61.94 
 
 		 387 aa  492  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  62.4 
 
 		 384 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  62.4 
 
 		 384 aa  489  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1880  S-adenosylmethionine synthetase  63.47 
 
 		 387 aa  490  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  62.4 
 
 		 384 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  62.4 
 
 		 384 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2678  S-adenosylmethionine synthetase  61.84 
 
 		 403 aa  488  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.257721  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1928  S-adenosylmethionine synthetase  63.54 
 
 		 389 aa  490  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.10598e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  62.4 
 
 		 384 aa  489  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  62.4 
 
 		 384 aa  489  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  62.4 
 
 		 384 aa  489  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  62.4 
 
 		 384 aa  489  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  62.4 
 
 		 384 aa  488  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  61.88 
 
 		 384 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  61.56 
 
 		 383 aa  488  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0349  S-adenosylmethionine synthetase  62.86 
 
 		 388 aa  486  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000664302  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1332  S-adenosylmethionine synthetase  62.18 
 
 		 389 aa  486  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000124955  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  61.78 
 
 		 390 aa  485  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  62.14 
 
 		 384 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  62.14 
 
 		 384 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  61.62 
 
 		 384 aa  487  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  62.14 
 
 		 384 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  60.84 
 
 		 383 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0843  S-adenosylmethionine synthetase  61.1 
 
 		 384 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000750109  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0532  S-adenosylmethionine synthetase  63.02 
 
 		 389 aa  481  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.347962  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0841  S-adenosylmethionine synthetase  61.1 
 
 		 384 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  60.84 
 
 		 383 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0826  S-adenosylmethionine synthetase  60.84 
 
 		 383 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  61.88 
 
 		 384 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  60.84 
 
 		 383 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  60.57 
 
 		 383 aa  481  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0690  Methionine adenosyltransferase  63.02 
 
 		 389 aa  481  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0374372  hitchhiker  0.00000199833 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  61.04 
 
 		 383 aa  483  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  61.1 
 
 		 383 aa  482  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  61.1 
 
 		 383 aa  482  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  60.05 
 
 		 383 aa  484  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0873  S-adenosylmethionine synthetase  60.78 
 
 		 383 aa  481  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3347  S-adenosylmethionine synthetase  61.1 
 
 		 384 aa  483  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  61.1 
 
 		 383 aa  482  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3974  S-adenosylmethionine synthetase  61.1 
 
 		 384 aa  482  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  60.52 
 
 		 383 aa  481  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  60.05 
 
 		 399 aa  481  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  60.31 
 
 		 383 aa  479  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0044  S-adenosylmethionine synthetase  62.34 
 
 		 388 aa  481  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000084119  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2760  S-adenosylmethionine synthetase  60.53 
 
 		 383 aa  479  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0201  S-adenosylmethionine synthetase  60.42 
 
 		 387 aa  477  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  59.55 
 
 		 399 aa  477  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0156  S-adenosylmethionine synthetase  60.94 
 
 		 387 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  60.91 
 
 		 396 aa  478  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3252  S-adenosylmethionine synthetase  59.49 
 
 		 393 aa  476  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  59.05 
 
 		 399 aa  473  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  59.05 
 
 		 399 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  59.05 
 
 		 399 aa  473  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  58.79 
 
 		 399 aa  471  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  59.05 
 
 		 399 aa  473  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  58.79 
 
 		 399 aa  471  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1857  S-adenosylmethionine synthetase  60.25 
 
 		 399 aa  473  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  59.38 
 
 		 388 aa  473  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1821  S-adenosylmethionine synthetase  59.21 
 
 		 385 aa  473  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0267535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  58.79 
 
 		 399 aa  471  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  59.05 
 
 		 403 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2541  S-adenosylmethionine synthetase  60.47 
 
 		 399 aa  472  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.245618  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  59.68 
 
 		 382 aa  472  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1864  S-adenosylmethionine synthetase  60 
 
 		 399 aa  474  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  59.95 
 
 		 396 aa  474  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0367  S-adenosylmethionine synthetase  58.46 
 
 		 389 aa  473  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.913598 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  59.05 
 
 		 399 aa  473  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  58.79 
 
 		 399 aa  471  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  59.69 
 
 		 389 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1256  S-adenosylmethionine synthetase  57.51 
 
 		 395 aa  469  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.247936  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  58.21 
 
 		 395 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5604  S-adenosylmethionine synthetase  58.72 
 
 		 393 aa  469  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2850  S-adenosylmethionine synthetase  61.66 
 
 		 388 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  58.21 
 
 		 395 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0787  S-adenosylmethionine synthetase  59.11 
 
 		 384 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.451532  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0161  S-adenosylmethionine synthetase  64.14 
 
 		 388 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1853  S-adenosylmethionine synthetase  59.23 
 
 		 399 aa  467  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0451389  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0683  S-adenosylmethionine synthetase  59.06 
 
 		 393 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  59.39 
 
 		 396 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0126  S-adenosylmethionine synthetase  58.35 
 
 		 393 aa  466  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  59.32 
 
 		 381 aa  468  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2894  S-adenosylmethionine synthetase  59.79 
 
 		 391 aa  464  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  57.97 
 
 		 398 aa  466  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3880  S-adenosylmethionine synthetase  58.1 
 
 		 393 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.356419  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0875  S-adenosylmethionine synthetase  59.11 
 
 		 384 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0705  S-adenosylmethionine synthetase  59.06 
 
 		 393 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.102884 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2262  S-adenosylmethionine synthetase  59.01 
 
 		 385 aa  467  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  57.97 
 
 		 398 aa  466  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  58.29 
 
 		 403 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0172  S-adenosylmethionine synthetase  64.14 
 
 		 390 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  58.23 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>