52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3254 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3254  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  499  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1851  Methyltransferase type 11  47.86 
 
 		 236 aa  242  3e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0834  hypothetical protein  26.29 
 
 		 239 aa  72  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0810  hypothetical protein  24.89 
 
 		 239 aa  72  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.71 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  28.46 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1455  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.29 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1410  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.29 
 
 		 255 aa  51.2  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.63 
 
 		 256 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.3 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.91 
 
 		 256 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.13 
 
 		 256 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3331  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.88 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.911002 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0151  methyltransferase type 12  30.71 
 
 		 491 aa  45.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.319391  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2887  SAM-binding motif-containing protein  32 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.015318 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.23 
 
 		 256 aa  45.8  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  25.25 
 
 		 252 aa  45.4  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0237  Methyltransferase type 11  28.36 
 
 		 248 aa  45.4  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.63 
 
 		 252 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  26.01 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  32.06 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.17 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4839  putative methyltransferase  32.76 
 
 		 271 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1922  trans-aconitate 2-methyltransferase  22.39 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.146762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.77 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.19 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.88 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.88 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  23.88 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  25 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  28.3 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  23.88 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  26.77 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3158  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.56 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  26.77 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  25 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.81 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  26.28 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.12 
 
 		 259 aa  43.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  25.53 
 
 		 262 aa  42.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 201 aa  42.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  24.41 
 
 		 255 aa  42.7  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  29 
 
 		 337 aa  42.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 268 aa  42.4  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  24.86 
 
 		 206 aa  42.4  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  23.08 
 
 		 271 aa  42.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.13 
 
 		 224 aa  42.4  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2414  hypothetical protein  28.43 
 
 		 351 aa  42  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177274  normal  0.0190439 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.43 
 
 		 257 aa  42  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  25.83 
 
 		 267 aa  41.6  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3189  MCP methyltransferase, CheR-type  24.39 
 
 		 297 aa  41.6  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00181305  normal  0.0716024 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>