75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2088 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2088  ACT domain-containing protein  100 
 
 
143 aa  290  6e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1522  amino acid-binding ACT domain-containing protein  81.12 
 
 
170 aa  238  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0251264 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0447  amino acid-binding ACT domain protein  81.56 
 
 
143 aa  232  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.266025 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1138  amino acid-binding ACT domain protein  71.13 
 
 
143 aa  213  7e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000787959  normal  0.731263 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1120  amino acid-binding ACT domain protein  70 
 
 
143 aa  209  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.298875  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1736  ACT domain-containing protein  68.09 
 
 
143 aa  205  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567956  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2191  amino acid-binding ACT domain protein  69.01 
 
 
143 aa  204  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0796  amino acid-binding ACT domain protein  71.63 
 
 
143 aa  204  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1824  ACT domain-containing protein  68.09 
 
 
143 aa  203  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2036  amino acid-binding ACT domain protein  67.61 
 
 
143 aa  201  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000214069 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1859  amino acid-binding ACT domain protein  66.9 
 
 
143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00254903  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2132  amino acid-binding ACT domain-containing protein  65.49 
 
 
143 aa  197  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0184772  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1670  amino acid-binding ACT domain-containing protein  64.08 
 
 
143 aa  192  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1682  amino acid-binding ACT domain-containing protein  67.38 
 
 
143 aa  192  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2322  amino acid-binding ACT domain-containing protein  60.99 
 
 
143 aa  177  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2883  amino acid-binding ACT domain-containing protein  56.34 
 
 
143 aa  170  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0514  ACT domain-containing protein  56.03 
 
 
143 aa  163  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3510  amino acid-binding ACT domain protein  54.61 
 
 
143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0260882  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1570  ACT domain-containing protein  55.63 
 
 
143 aa  161  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1575  amino acid-binding ACT domain-containing protein  56.72 
 
 
143 aa  157  6e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.114486  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0670  amino acid-binding ACT domain protein  51.77 
 
 
143 aa  149  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0616  ACT domain-containing protein  51.06 
 
 
143 aa  149  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0167  amino acid-binding ACT domain protein  50.7 
 
 
143 aa  147  6e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0816  amino acid-binding ACT  49.28 
 
 
142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.842739  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1503  amino acid-binding ACT domain protein  49.65 
 
 
143 aa  142  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0832  amino acid-binding ACT domain-containing protein  49.21 
 
 
147 aa  134  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0037  ACT domain-containing protein  45.77 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0261  amino acid-binding ACT domain-containing protein  43.61 
 
 
144 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0053  amino acid-binding ACT domain protein  45.77 
 
 
147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0041  amino acid-binding ACT domain protein  45.77 
 
 
147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0040  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.96 
 
 
147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1971  amino acid-binding ACT domain-containing protein  48.82 
 
 
142 aa  127  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0069  amino acid-binding ACT domain protein  48.03 
 
 
142 aa  122  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2859  amino acid-binding ACT domain protein  41.96 
 
 
151 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1421  hypothetical protein  43.48 
 
 
151 aa  121  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3082  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.55 
 
 
143 aa  120  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0074  amino acid-binding ACT domain protein  43.66 
 
 
142 aa  120  5e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4321  ACT domain-containing protein  44.22 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0708  amino acid-binding ACT domain-containing protein  45.11 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.464159  normal  0.126423 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0065  hypothetical protein  43.66 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0860  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.13 
 
 
141 aa  117  7e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0495792  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0168  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40.43 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0210  acetolactate synthase small subunit  40.71 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.846842 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1743  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40.43 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.237603 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3086  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.86 
 
 
135 aa  115  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.13 
 
 
141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1623  amino acid-binding ACT  40.58 
 
 
144 aa  113  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0071  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.44 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0748  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.96 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00491505  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2122  amino acid-binding ACT domain protein  46.51 
 
 
144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1579  amino acid-binding ACT domain protein  40.29 
 
 
142 aa  108  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.210637 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06230  ACT domain-containing protein  37.59 
 
 
142 aa  105  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.58032  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0208  amino acid-binding (ACT) protein  43.2 
 
 
145 aa  102  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13420  ACT domain-containing protein  41.73 
 
 
142 aa  100  6e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0901  ACT domain-containing protein  37.1 
 
 
129 aa  97.8  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_885  ACT domain protein  35.94 
 
 
129 aa  97.8  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1014  ACT domain-containing protein  35.16 
 
 
129 aa  96.7  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1584  amino acid-binding ACT domain protein  40.38 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0505283 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1319  ACT domain-containing protein  32.39 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0720  putative acetolactate synthase small regulatory subunit  30.08 
 
 
151 aa  80.1  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.726001 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1455  hypothetical protein  30.71 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.323054 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0909  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.85 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.394001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2427  amino acid-binding ACT domain protein  33 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.662665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2514  amino acid-binding ACT domain protein  32 
 
 
129 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1433  ACT domain-containing protein  32 
 
 
129 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.50436  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2396  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3113  amino acid-binding ACT domain protein  32.74 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1309  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.39 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0326  hypothetical protein  26.8 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1107  acetolactate synthase small subunit  25 
 
 
136 aa  47  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0873  amino acid-binding ACT  23.31 
 
 
152 aa  46.2  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2624  acetolactate synthase, small subunit  40 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2879  amino acid-binding ACT domain-containing protein  22.86 
 
 
128 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555565 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1243  aspartate kinase  33 
 
 
392 aa  41.2  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
232 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>