76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0816 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0816  amino acid-binding ACT  100 
 
 
142 aa  288  2e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.842739  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1575  amino acid-binding ACT domain-containing protein  63.57 
 
 
143 aa  183  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.114486  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0616  ACT domain-containing protein  58.45 
 
 
143 aa  179  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0514  ACT domain-containing protein  62.14 
 
 
143 aa  176  9e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0167  amino acid-binding ACT domain protein  60.71 
 
 
143 aa  175  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3510  amino acid-binding ACT domain protein  60.71 
 
 
143 aa  174  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0260882  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1503  amino acid-binding ACT domain protein  57.86 
 
 
143 aa  170  6.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1682  amino acid-binding ACT domain-containing protein  53.9 
 
 
143 aa  169  9e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2883  amino acid-binding ACT domain-containing protein  55.71 
 
 
143 aa  165  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1736  ACT domain-containing protein  52.86 
 
 
143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567956  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1859  amino acid-binding ACT domain protein  52.14 
 
 
143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00254903  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2132  amino acid-binding ACT domain-containing protein  53.57 
 
 
143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0184772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1824  ACT domain-containing protein  52.14 
 
 
143 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1670  amino acid-binding ACT domain-containing protein  50 
 
 
143 aa  158  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2191  amino acid-binding ACT domain protein  51.43 
 
 
143 aa  157  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2036  amino acid-binding ACT domain protein  51.43 
 
 
143 aa  157  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000214069 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1522  amino acid-binding ACT domain-containing protein  53.62 
 
 
170 aa  156  8e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0251264 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0670  amino acid-binding ACT domain protein  53.57 
 
 
143 aa  155  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1138  amino acid-binding ACT domain protein  50 
 
 
143 aa  154  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000787959  normal  0.731263 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0447  amino acid-binding ACT domain protein  51.08 
 
 
143 aa  151  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.266025 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0796  amino acid-binding ACT domain protein  50 
 
 
143 aa  150  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2088  ACT domain-containing protein  49.28 
 
 
143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2322  amino acid-binding ACT domain-containing protein  47.37 
 
 
143 aa  142  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0261  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40.71 
 
 
144 aa  141  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1120  amino acid-binding ACT domain protein  47.1 
 
 
143 aa  140  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.298875  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0168  amino acid-binding ACT domain-containing protein  47.83 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1570  ACT domain-containing protein  45.71 
 
 
143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0860  amino acid-binding ACT domain-containing protein  47.83 
 
 
141 aa  138  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0495792  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1743  amino acid-binding ACT domain-containing protein  47.1 
 
 
141 aa  137  7e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.237603 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  45.65 
 
 
141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0053  amino acid-binding ACT domain protein  46.04 
 
 
147 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0041  amino acid-binding ACT domain protein  46.04 
 
 
147 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0832  amino acid-binding ACT domain-containing protein  46.32 
 
 
147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219299  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0210  acetolactate synthase small subunit  43.8 
 
 
145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.846842 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0208  amino acid-binding (ACT) protein  44.37 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0037  ACT domain-containing protein  44.6 
 
 
147 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0040  amino acid-binding ACT domain-containing protein  43.17 
 
 
147 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06230  ACT domain-containing protein  41.55 
 
 
142 aa  120  5e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.58032  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0069  amino acid-binding ACT domain protein  43.26 
 
 
142 aa  120  7e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3086  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.48 
 
 
135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1579  amino acid-binding ACT domain protein  40.85 
 
 
142 aa  117  7e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.210637 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2859  amino acid-binding ACT domain protein  44.12 
 
 
151 aa  117  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4321  ACT domain-containing protein  38.89 
 
 
149 aa  115  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_885  ACT domain protein  42.52 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1421  hypothetical protein  42.65 
 
 
151 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1971  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40.71 
 
 
142 aa  114  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1014  ACT domain-containing protein  42.52 
 
 
129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0074  amino acid-binding ACT domain protein  40.71 
 
 
142 aa  114  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0901  ACT domain-containing protein  43.44 
 
 
129 aa  114  6e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0065  hypothetical protein  41.43 
 
 
142 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0708  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.48 
 
 
144 aa  108  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.464159  normal  0.126423 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0071  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40.44 
 
 
145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3082  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40 
 
 
143 aa  107  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13420  ACT domain-containing protein  41.26 
 
 
142 aa  107  8.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1623  amino acid-binding ACT  40.8 
 
 
144 aa  104  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2122  amino acid-binding ACT domain protein  41.8 
 
 
144 aa  102  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0748  amino acid-binding ACT domain-containing protein  39.86 
 
 
143 aa  100  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00491505  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0720  putative acetolactate synthase small regulatory subunit  33.81 
 
 
151 aa  96.7  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.726001 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1319  ACT domain-containing protein  36.36 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1584  amino acid-binding ACT domain protein  33.81 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0505283 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1455  hypothetical protein  34.85 
 
 
144 aa  92.8  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.323054 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0909  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.93 
 
 
153 aa  83.6  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.394001  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3113  amino acid-binding ACT domain protein  35.71 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1433  ACT domain-containing protein  33.02 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.50436  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2427  amino acid-binding ACT domain protein  33.02 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.662665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2514  amino acid-binding ACT domain protein  33.02 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583261  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0873  amino acid-binding ACT  31.65 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2396  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.51 
 
 
129 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0326  hypothetical protein  31.68 
 
 
125 aa  58.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1107  acetolactate synthase small subunit  25 
 
 
136 aa  47.4  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1309  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.4 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2879  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.57 
 
 
128 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555565 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0528  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.68 
 
 
165 aa  41.6  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.973022 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2624  acetolactate synthase, small subunit  36.54 
 
 
160 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2774  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  25.52 
 
 
163 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.805541  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0523  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.98 
 
 
165 aa  40.4  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.612451  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>