118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1682 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1682  amino acid-binding ACT domain-containing protein  100 
 
 		 143 aa  286  6e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1138  amino acid-binding ACT domain protein  72.73 
 
 		 143 aa  222  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000787959  normal  0.731263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1736  ACT domain-containing protein  71.33 
 
 		 143 aa  210  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567956  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0796  amino acid-binding ACT domain protein  69.23 
 
 		 143 aa  207  5e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1522  amino acid-binding ACT domain-containing protein  69.72 
 
 		 170 aa  206  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0251264 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0447  amino acid-binding ACT domain protein  71.63 
 
 		 143 aa  205  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.266025 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2132  amino acid-binding ACT domain-containing protein  69.93 
 
 		 143 aa  203  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0184772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1824  ACT domain-containing protein  67.83 
 
 		 143 aa  201  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2322  amino acid-binding ACT domain-containing protein  66.43 
 
 		 143 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1670  amino acid-binding ACT domain-containing protein  67.13 
 
 		 143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1859  amino acid-binding ACT domain protein  67.13 
 
 		 143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00254903  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2088  ACT domain-containing protein  67.38 
 
 		 143 aa  192  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2191  amino acid-binding ACT domain protein  65.73 
 
 		 143 aa  190  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1120  amino acid-binding ACT domain protein  64.08 
 
 		 143 aa  189  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.298875  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2036  amino acid-binding ACT domain protein  65.73 
 
 		 143 aa  187  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000214069 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1570  ACT domain-containing protein  63.12 
 
 		 143 aa  184  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2883  amino acid-binding ACT domain-containing protein  55.94 
 
 		 143 aa  177  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0514  ACT domain-containing protein  56.64 
 
 		 143 aa  169  9e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0816  amino acid-binding ACT  53.9 
 
 		 142 aa  169  9e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.842739  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1575  amino acid-binding ACT domain-containing protein  57.97 
 
 		 143 aa  168  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.114486  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3510  amino acid-binding ACT domain protein  53.15 
 
 		 143 aa  166  7e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0260882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1503  amino acid-binding ACT domain protein  51.75 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0616  ACT domain-containing protein  51.05 
 
 		 143 aa  160  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0167  amino acid-binding ACT domain protein  53.15 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0670  amino acid-binding ACT domain protein  50 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0832  amino acid-binding ACT domain-containing protein  50.37 
 
 		 147 aa  144  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219299  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0261  amino acid-binding ACT domain-containing protein  46.56 
 
 		 144 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.06 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0040  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.06 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0041  amino acid-binding ACT domain protein  45.45 
 
 		 147 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0053  amino acid-binding ACT domain protein  45.45 
 
 		 147 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0860  amino acid-binding ACT domain-containing protein  43.36 
 
 		 141 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0495792  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1743  amino acid-binding ACT domain-containing protein  43.36 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.237603 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0037  ACT domain-containing protein  44.06 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0168  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.66 
 
 		 141 aa  130  5e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0074  amino acid-binding ACT domain protein  44.76 
 
 		 142 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0069  amino acid-binding ACT domain protein  46.48 
 
 		 142 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4321  ACT domain-containing protein  42.07 
 
 		 149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0065  hypothetical protein  43.36 
 
 		 142 aa  123  7e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1971  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.37 
 
 		 142 aa  123  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0071  amino acid-binding ACT domain-containing protein  45.59 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3086  amino acid-binding ACT domain-containing protein  43.61 
 
 		 135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0210  acetolactate synthase small subunit  40.15 
 
 		 145 aa  118  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.846842 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3082  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40.56 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2859  amino acid-binding ACT domain protein  40.43 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1421  hypothetical protein  41.43 
 
 		 151 aa  117  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0208  amino acid-binding (ACT) protein  41.35 
 
 		 145 aa  112  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1579  amino acid-binding ACT domain protein  40.15 
 
 		 142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.210637 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06230  ACT domain-containing protein  39.29 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.58032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0708  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.54 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.464159  normal  0.126423 
 
 
-
 
NC_002936  DET1014  ACT domain-containing protein  38.28 
 
 		 129 aa  104  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1623  amino acid-binding ACT  41.67 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_885  ACT domain protein  37.5 
 
 		 129 aa  103  8e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0901  ACT domain-containing protein  39.2 
 
 		 129 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0748  amino acid-binding ACT domain-containing protein  38.97 
 
 		 143 aa  100  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00491505  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1319  ACT domain-containing protein  34.72 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13420  ACT domain-containing protein  38.3 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2122  amino acid-binding ACT domain protein  40.65 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1455  hypothetical protein  32.84 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.323054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0720  putative acetolactate synthase small regulatory subunit  31.3 
 
 		 151 aa  87  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726001 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1584  amino acid-binding ACT domain protein  39.42 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0505283 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0909  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.12 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.394001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2427  amino acid-binding ACT domain protein  38 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.662665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2514  amino acid-binding ACT domain protein  37 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1433  ACT domain-containing protein  36 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.50436  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2396  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.07 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3113  amino acid-binding ACT domain protein  33.93 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1107  acetolactate synthase small subunit  26.92 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0873  amino acid-binding ACT  25.76 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2879  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.77 
 
 		 128 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555565 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0326  hypothetical protein  25 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2139  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  32.26 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.141993  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0610  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.62 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948647 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3400  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  30.17 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2931  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  30.17 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3530  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  30.17 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2387  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  31.87 
 
 		 164 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474277  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2375  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  31.87 
 
 		 164 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0991612  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2491  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  31.87 
 
 		 164 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126247  hitchhiker  0.000727987 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1972  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  31.87 
 
 		 164 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0607984  hitchhiker  0.0000404141 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2019  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  28.83 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1749  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  33.33 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.306169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1829  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  33.33 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2270  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  33.33 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1309  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.27 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2278  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  32.26 
 
 		 164 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1627  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  32.26 
 
 		 164 aa  41.6  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.800745  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1775  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  31.87 
 
 		 164 aa  41.6  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1910  acetolactate synthase, small subunit  31.87 
 
 		 164 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.115995  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0129  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  28.83 
 
 		 164 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.942992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0128  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  28.83 
 
 		 164 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.480792  hitchhiker  0.000114859 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0133  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  28.83 
 
 		 164 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0126  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  28.83 
 
 		 164 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3521  acetolactate synthase, small subunit  28.83 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0084  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  28.83 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0080  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  28.83 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3680  acetolactate synthase, small subunit  32.79 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.32274  normal  0.136777 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0133  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  28.83 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.103905 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0893  acetolactate synthase, small subunit  35.53 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.254483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0746  acetolactate synthase, small subunit  35.53 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>