75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1824 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1824  ACT domain-containing protein  100 
 
 		 143 aa  288  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1736  ACT domain-containing protein  87.41 
 
 		 143 aa  258  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567956  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2132  amino acid-binding ACT domain-containing protein  83.22 
 
 		 143 aa  243  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0184772  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1859  amino acid-binding ACT domain protein  82.52 
 
 		 143 aa  241  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00254903  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2036  amino acid-binding ACT domain protein  80.42 
 
 		 143 aa  234  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000214069 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1670  amino acid-binding ACT domain-containing protein  81.82 
 
 		 143 aa  234  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2191  amino acid-binding ACT domain protein  80.42 
 
 		 143 aa  233  9e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2088  ACT domain-containing protein  68.09 
 
 		 143 aa  203  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1682  amino acid-binding ACT domain-containing protein  67.83 
 
 		 143 aa  201  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1522  amino acid-binding ACT domain-containing protein  66.2 
 
 		 170 aa  197  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0251264 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0447  amino acid-binding ACT domain protein  66.67 
 
 		 143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.266025 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1138  amino acid-binding ACT domain protein  64.34 
 
 		 143 aa  192  9e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000787959  normal  0.731263 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1570  ACT domain-containing protein  67.38 
 
 		 143 aa  187  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1120  amino acid-binding ACT domain protein  61.97 
 
 		 143 aa  187  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.298875  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0796  amino acid-binding ACT domain protein  62.24 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2322  amino acid-binding ACT domain-containing protein  58.74 
 
 		 143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1575  amino acid-binding ACT domain-containing protein  61.19 
 
 		 143 aa  173  7e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.114486  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2883  amino acid-binding ACT domain-containing protein  57.34 
 
 		 143 aa  170  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0514  ACT domain-containing protein  57.34 
 
 		 143 aa  167  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0616  ACT domain-containing protein  53.15 
 
 		 143 aa  164  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3510  amino acid-binding ACT domain protein  55.24 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0260882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0816  amino acid-binding ACT  52.14 
 
 		 142 aa  160  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.842739  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0167  amino acid-binding ACT domain protein  53.15 
 
 		 143 aa  159  9e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1503  amino acid-binding ACT domain protein  51.75 
 
 		 143 aa  156  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0832  amino acid-binding ACT domain-containing protein  51.47 
 
 		 147 aa  147  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219299  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0670  amino acid-binding ACT domain protein  50.7 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0053  amino acid-binding ACT domain protein  47.55 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0041  amino acid-binding ACT domain protein  47.55 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0037  ACT domain-containing protein  46.85 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0261  amino acid-binding ACT domain-containing protein  46.97 
 
 		 144 aa  137  6e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0040  amino acid-binding ACT domain-containing protein  45.45 
 
 		 147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3082  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.66 
 
 		 143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1743  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.96 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.237603 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0860  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.96 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0495792  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0168  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.26 
 
 		 141 aa  126  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4321  ACT domain-containing protein  44.14 
 
 		 149 aa  125  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.96 
 
 		 141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1971  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.25 
 
 		 142 aa  123  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0210  acetolactate synthase small subunit  42.11 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.846842 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0069  amino acid-binding ACT domain protein  40.85 
 
 		 142 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0065  hypothetical protein  39.86 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0071  amino acid-binding ACT domain-containing protein  45.19 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0074  amino acid-binding ACT domain protein  39.58 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1421  hypothetical protein  40.58 
 
 		 151 aa  114  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06230  ACT domain-containing protein  39.71 
 
 		 142 aa  113  7.999999999999999e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.58032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2859  amino acid-binding ACT domain protein  39.13 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1579  amino acid-binding ACT domain protein  38.85 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.210637 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0208  amino acid-binding (ACT) protein  42.86 
 
 		 145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0708  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.54 
 
 		 144 aa  110  7.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.464159  normal  0.126423 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3086  amino acid-binding ACT domain-containing protein  36.57 
 
 		 135 aa  110  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1623  amino acid-binding ACT  42.54 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0901  ACT domain-containing protein  38.71 
 
 		 129 aa  103  9e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_885  ACT domain protein  37.5 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0748  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.18 
 
 		 143 aa  102  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00491505  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1014  ACT domain-containing protein  36.72 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13420  ACT domain-containing protein  36.17 
 
 		 142 aa  98.6  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2122  amino acid-binding ACT domain protein  43.2 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1455  hypothetical protein  38.6 
 
 		 144 aa  90.5  8e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.323054 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1319  ACT domain-containing protein  35.42 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0720  putative acetolactate synthase small regulatory subunit  33.83 
 
 		 151 aa  84.7  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726001 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1584  amino acid-binding ACT domain protein  35.58 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0505283 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0909  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.65 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.394001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2427  amino acid-binding ACT domain protein  36.36 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.662665  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1433  ACT domain-containing protein  36.36 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.50436  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2514  amino acid-binding ACT domain protein  35.35 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583261  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2396  amino acid-binding ACT domain-containing protein  38.78 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3113  amino acid-binding ACT domain protein  34.82 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0326  hypothetical protein  30.3 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0873  amino acid-binding ACT  24.81 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2879  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.59 
 
 		 128 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555565 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1107  acetolactate synthase small subunit  26.52 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1309  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.43 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2624  acetolactate synthase, small subunit  34.48 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0893  acetolactate synthase, small subunit  38.98 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.254483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0746  acetolactate synthase, small subunit  38.98 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>