77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0860 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0860  amino acid-binding ACT domain-containing protein  100 
 
 
141 aa  279  9e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0495792  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1743  amino acid-binding ACT domain-containing protein  99.29 
 
 
141 aa  278  3e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.237603 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0168  amino acid-binding ACT domain-containing protein  97.87 
 
 
141 aa  275  2e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  85.11 
 
 
141 aa  243  4.9999999999999997e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1503  amino acid-binding ACT domain protein  56.64 
 
 
143 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0074  amino acid-binding ACT domain protein  53.57 
 
 
142 aa  159  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1971  amino acid-binding ACT domain-containing protein  51.43 
 
 
142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0065  hypothetical protein  50.71 
 
 
142 aa  152  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0069  amino acid-binding ACT domain protein  50.7 
 
 
142 aa  150  4e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0616  ACT domain-containing protein  50.35 
 
 
143 aa  143  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0167  amino acid-binding ACT domain protein  46.85 
 
 
143 aa  143  8.000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3510  amino acid-binding ACT domain protein  47.52 
 
 
143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0260882  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3082  amino acid-binding ACT domain-containing protein  47.52 
 
 
143 aa  138  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0816  amino acid-binding ACT  47.83 
 
 
142 aa  138  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.842739  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0670  amino acid-binding ACT domain protein  48.59 
 
 
143 aa  138  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0514  ACT domain-containing protein  51.77 
 
 
143 aa  137  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2883  amino acid-binding ACT domain-containing protein  46.15 
 
 
143 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1682  amino acid-binding ACT domain-containing protein  43.36 
 
 
143 aa  133  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1736  ACT domain-containing protein  44.76 
 
 
143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567956  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1859  amino acid-binding ACT domain protein  44.06 
 
 
143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00254903  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1575  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.06 
 
 
143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.114486  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1138  amino acid-binding ACT domain protein  40.56 
 
 
143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000787959  normal  0.731263 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2132  amino acid-binding ACT domain-containing protein  45.45 
 
 
143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0184772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1824  ACT domain-containing protein  41.96 
 
 
143 aa  128  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2322  amino acid-binding ACT domain-containing protein  39.16 
 
 
143 aa  127  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1522  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.25 
 
 
170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0251264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2191  amino acid-binding ACT domain protein  42.66 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1670  amino acid-binding ACT domain-containing protein  43.36 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1570  ACT domain-containing protein  41.96 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2036  amino acid-binding ACT domain protein  43.36 
 
 
143 aa  124  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000214069 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0447  amino acid-binding ACT domain protein  42.55 
 
 
143 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.266025 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2088  ACT domain-containing protein  41.13 
 
 
143 aa  117  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0796  amino acid-binding ACT domain protein  39.86 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1120  amino acid-binding ACT domain protein  41.43 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.298875  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0208  amino acid-binding (ACT) protein  39.72 
 
 
145 aa  114  6e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0832  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.3 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219299  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0261  amino acid-binding ACT domain-containing protein  36.17 
 
 
144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0210  acetolactate synthase small subunit  39.72 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.846842 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06230  ACT domain-containing protein  39.72 
 
 
142 aa  108  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.58032  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3086  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.22 
 
 
135 aa  105  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1579  amino acid-binding ACT domain protein  36.17 
 
 
142 aa  103  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.210637 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0053  amino acid-binding ACT domain protein  34.97 
 
 
147 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0041  amino acid-binding ACT domain protein  34.97 
 
 
147 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1623  amino acid-binding ACT  36.5 
 
 
144 aa  101  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0748  amino acid-binding ACT domain-containing protein  38.81 
 
 
143 aa  101  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00491505  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2122  amino acid-binding ACT domain protein  36.3 
 
 
144 aa  101  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0037  ACT domain-containing protein  34.27 
 
 
147 aa  97.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0040  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.87 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_885  ACT domain protein  44.96 
 
 
129 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4321  ACT domain-containing protein  45.19 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1014  ACT domain-containing protein  43.41 
 
 
129 aa  95.1  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0708  amino acid-binding ACT domain-containing protein  36.09 
 
 
144 aa  92  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.464159  normal  0.126423 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0071  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.29 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0901  ACT domain-containing protein  44 
 
 
129 aa  91.3  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1455  hypothetical protein  32.61 
 
 
144 aa  90.9  6e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.323054 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1421  hypothetical protein  34.27 
 
 
151 aa  89  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2859  amino acid-binding ACT domain protein  34.75 
 
 
151 aa  89  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13420  ACT domain-containing protein  35.92 
 
 
142 aa  86.7  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1319  ACT domain-containing protein  30.56 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1584  amino acid-binding ACT domain protein  30.43 
 
 
144 aa  82  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0505283 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0720  putative acetolactate synthase small regulatory subunit  29.5 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.726001 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2427  amino acid-binding ACT domain protein  30.77 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.662665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2514  amino acid-binding ACT domain protein  29.81 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583261  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0909  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.88 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.394001  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1433  ACT domain-containing protein  28.85 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.50436  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2396  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.8 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3113  amino acid-binding ACT domain protein  31.9 
 
 
137 aa  61.2  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1107  acetolactate synthase small subunit  29.41 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0873  amino acid-binding ACT  26.09 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2624  acetolactate synthase, small subunit  33.33 
 
 
160 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01980  acetolactate synthase, small subunit  43.18 
 
 
161 aa  40.4  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000298092  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0126  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.18 
 
 
164 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0133  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.18 
 
 
164 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0133  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.18 
 
 
169 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.103905 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0128  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.18 
 
 
164 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.480792  hitchhiker  0.000114859 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0129  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.18 
 
 
164 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.942992  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2879  amino acid-binding ACT domain-containing protein  23.47 
 
 
128 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>