74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1670 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1670  amino acid-binding ACT domain-containing protein  100 
 
 
143 aa  289  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1859  amino acid-binding ACT domain protein  84.62 
 
 
143 aa  247  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00254903  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1824  ACT domain-containing protein  81.82 
 
 
143 aa  234  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1736  ACT domain-containing protein  79.72 
 
 
143 aa  233  9e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567956  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2036  amino acid-binding ACT domain protein  79.72 
 
 
143 aa  231  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000214069 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2132  amino acid-binding ACT domain-containing protein  81.12 
 
 
143 aa  231  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0184772  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2191  amino acid-binding ACT domain protein  79.02 
 
 
143 aa  230  6e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0447  amino acid-binding ACT domain protein  68.09 
 
 
143 aa  199  8e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.266025 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1522  amino acid-binding ACT domain-containing protein  66.2 
 
 
170 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0251264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1682  amino acid-binding ACT domain-containing protein  67.13 
 
 
143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1138  amino acid-binding ACT domain protein  66.43 
 
 
143 aa  197  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000787959  normal  0.731263 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2088  ACT domain-containing protein  64.08 
 
 
143 aa  192  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1570  ACT domain-containing protein  65.73 
 
 
143 aa  186  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0796  amino acid-binding ACT domain protein  61.54 
 
 
143 aa  184  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1120  amino acid-binding ACT domain protein  62.86 
 
 
143 aa  184  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.298875  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0514  ACT domain-containing protein  60.14 
 
 
143 aa  177  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2322  amino acid-binding ACT domain-containing protein  56.64 
 
 
143 aa  176  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3510  amino acid-binding ACT domain protein  57.34 
 
 
143 aa  174  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0260882  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2883  amino acid-binding ACT domain-containing protein  57.34 
 
 
143 aa  171  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1575  amino acid-binding ACT domain-containing protein  58.21 
 
 
143 aa  165  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.114486  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0816  amino acid-binding ACT  50 
 
 
142 aa  158  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.842739  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1503  amino acid-binding ACT domain protein  53.15 
 
 
143 aa  158  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0616  ACT domain-containing protein  51.75 
 
 
143 aa  157  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0167  amino acid-binding ACT domain protein  51.05 
 
 
143 aa  156  9e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0832  amino acid-binding ACT domain-containing protein  51.85 
 
 
147 aa  149  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219299  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0670  amino acid-binding ACT domain protein  51.06 
 
 
143 aa  143  7.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0037  ACT domain-containing protein  45.45 
 
 
147 aa  134  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0040  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.06 
 
 
147 aa  133  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0053  amino acid-binding ACT domain protein  45.45 
 
 
147 aa  133  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0041  amino acid-binding ACT domain protein  45.45 
 
 
147 aa  133  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0071  amino acid-binding ACT domain-containing protein  51.11 
 
 
145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.68 
 
 
141 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0261  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40.29 
 
 
144 aa  127  8.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1743  amino acid-binding ACT domain-containing protein  43.36 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.237603 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0860  amino acid-binding ACT domain-containing protein  43.36 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0495792  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4321  ACT domain-containing protein  46.83 
 
 
149 aa  125  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3082  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.96 
 
 
143 aa  124  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0168  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.66 
 
 
141 aa  122  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1971  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.67 
 
 
142 aa  119  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0074  amino acid-binding ACT domain protein  42.36 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0069  amino acid-binding ACT domain protein  42.07 
 
 
142 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0065  hypothetical protein  39.16 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1421  hypothetical protein  39.01 
 
 
151 aa  114  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0210  acetolactate synthase small subunit  41.13 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.846842 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2859  amino acid-binding ACT domain protein  37.59 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1579  amino acid-binding ACT domain protein  40.29 
 
 
142 aa  110  8.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.210637 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0208  amino acid-binding (ACT) protein  42.11 
 
 
145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0901  ACT domain-containing protein  40.32 
 
 
129 aa  108  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_885  ACT domain protein  39.06 
 
 
129 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3086  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.82 
 
 
135 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1014  ACT domain-containing protein  39.06 
 
 
129 aa  107  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0708  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.54 
 
 
144 aa  106  9.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.464159  normal  0.126423 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1623  amino acid-binding ACT  40.29 
 
 
144 aa  102  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06230  ACT domain-containing protein  36.17 
 
 
142 aa  102  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.58032  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13420  ACT domain-containing protein  37.59 
 
 
142 aa  101  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2122  amino acid-binding ACT domain protein  42.65 
 
 
144 aa  101  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0748  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.8 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00491505  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1455  hypothetical protein  33.81 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.323054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0720  putative acetolactate synthase small regulatory subunit  32.84 
 
 
151 aa  84.7  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.726001 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0909  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.58 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.394001  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1584  amino acid-binding ACT domain protein  33.65 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0505283 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1319  ACT domain-containing protein  32.64 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2427  amino acid-binding ACT domain protein  35 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.662665  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1433  ACT domain-containing protein  35 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.50436  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2514  amino acid-binding ACT domain protein  34 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583261  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2396  amino acid-binding ACT domain-containing protein  37 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3113  amino acid-binding ACT domain protein  36.61 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0873  amino acid-binding ACT  24.06 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1107  acetolactate synthase small subunit  25.98 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2879  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555565 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1309  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.45 
 
 
142 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0326  hypothetical protein  27.27 
 
 
125 aa  41.6  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0399  threonine dehydratase, biosynthetic  31.4 
 
 
288 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2624  acetolactate synthase, small subunit  35.56 
 
 
160 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>