75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0616 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0616  ACT domain-containing protein  100 
 
 		 143 aa  281  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1503  amino acid-binding ACT domain protein  67.83 
 
 		 143 aa  193  8.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0670  amino acid-binding ACT domain protein  66.67 
 
 		 143 aa  189  9e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0816  amino acid-binding ACT  58.45 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.842739  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3510  amino acid-binding ACT domain protein  60.84 
 
 		 143 aa  177  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0260882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0514  ACT domain-containing protein  57.34 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2883  amino acid-binding ACT domain-containing protein  58.04 
 
 		 143 aa  174  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1575  amino acid-binding ACT domain-containing protein  60.14 
 
 		 143 aa  174  4e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.114486  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0167  amino acid-binding ACT domain protein  58.04 
 
 		 143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1736  ACT domain-containing protein  56.64 
 
 		 143 aa  169  9e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567956  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2132  amino acid-binding ACT domain-containing protein  56.64 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0184772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1824  ACT domain-containing protein  53.15 
 
 		 143 aa  164  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2191  amino acid-binding ACT domain protein  54.55 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2036  amino acid-binding ACT domain protein  53.85 
 
 		 143 aa  160  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000214069 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1682  amino acid-binding ACT domain-containing protein  51.05 
 
 		 143 aa  160  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1670  amino acid-binding ACT domain-containing protein  51.75 
 
 		 143 aa  157  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1522  amino acid-binding ACT domain-containing protein  53.19 
 
 		 170 aa  157  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0251264 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1138  amino acid-binding ACT domain protein  49.65 
 
 		 143 aa  156  9e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000787959  normal  0.731263 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1859  amino acid-binding ACT domain protein  51.75 
 
 		 143 aa  156  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00254903  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2322  amino acid-binding ACT domain-containing protein  48.95 
 
 		 143 aa  155  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0796  amino acid-binding ACT domain protein  51.75 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0447  amino acid-binding ACT domain protein  51.41 
 
 		 143 aa  153  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.266025 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2088  ACT domain-containing protein  51.06 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1570  ACT domain-containing protein  48.95 
 
 		 143 aa  147  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0065  hypothetical protein  47.55 
 
 		 142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0168  amino acid-binding ACT domain-containing protein  50.35 
 
 		 141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0860  amino acid-binding ACT domain-containing protein  50.35 
 
 		 141 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0495792  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0074  amino acid-binding ACT domain protein  47.55 
 
 		 142 aa  143  9e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1743  amino acid-binding ACT domain-containing protein  49.65 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.237603 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1971  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.76 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  51.06 
 
 		 141 aa  140  4e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1120  amino acid-binding ACT domain protein  51.56 
 
 		 143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.298875  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0069  amino acid-binding ACT domain protein  45.45 
 
 		 142 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0053  amino acid-binding ACT domain protein  45.07 
 
 		 147 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0041  amino acid-binding ACT domain protein  45.07 
 
 		 147 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0040  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.96 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0261  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.13 
 
 		 144 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0037  ACT domain-containing protein  43.66 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0832  amino acid-binding ACT domain-containing protein  43.61 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219299  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3086  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.96 
 
 		 135 aa  120  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3082  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40.56 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0208  amino acid-binding (ACT) protein  43.66 
 
 		 145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0210  acetolactate synthase small subunit  41.61 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.846842 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0748  amino acid-binding ACT domain-containing protein  46.56 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00491505  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13420  ACT domain-containing protein  42.96 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4321  ACT domain-containing protein  42.86 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1623  amino acid-binding ACT  41.73 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0708  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40.71 
 
 		 144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.464159  normal  0.126423 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1421  hypothetical protein  38.73 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2859  amino acid-binding ACT domain protein  38.73 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0071  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40.44 
 
 		 145 aa  107  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1579  amino acid-binding ACT domain protein  34.51 
 
 		 142 aa  107  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.210637 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0901  ACT domain-containing protein  41.27 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2122  amino acid-binding ACT domain protein  39.13 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_885  ACT domain protein  40 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1014  ACT domain-containing protein  39.23 
 
 		 129 aa  104  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06230  ACT domain-containing protein  40.88 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.58032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1319  ACT domain-containing protein  34.72 
 
 		 144 aa  97.1  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1455  hypothetical protein  35.04 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.323054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0720  putative acetolactate synthase small regulatory subunit  30.71 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726001 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0909  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.33 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.394001  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1584  amino acid-binding ACT domain protein  36.54 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0505283 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2427  amino acid-binding ACT domain protein  34.29 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.662665  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3113  amino acid-binding ACT domain protein  32.54 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2514  amino acid-binding ACT domain protein  32.32 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1433  ACT domain-containing protein  32.38 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.50436  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2396  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.77 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1107  acetolactate synthase small subunit  28.03 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0873  amino acid-binding ACT  27.07 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2879  amino acid-binding ACT domain-containing protein  25.96 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555565 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0326  hypothetical protein  26.73 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1570  ACT domain protein  27.13 
 
 		 130 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.409737  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 214 aa  41.6  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  38.81 
 
 		 339 aa  41.6  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  33.33 
 
 		 503 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>