74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0447 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0447  amino acid-binding ACT domain protein  100 
 
 
143 aa  291  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.266025 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1522  amino acid-binding ACT domain-containing protein  83.69 
 
 
170 aa  242  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0251264 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2088  ACT domain-containing protein  81.56 
 
 
143 aa  232  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1138  amino acid-binding ACT domain protein  78.72 
 
 
143 aa  231  3e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000787959  normal  0.731263 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1120  amino acid-binding ACT domain protein  75 
 
 
143 aa  218  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.298875  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0796  amino acid-binding ACT domain protein  75.89 
 
 
143 aa  216  7e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1682  amino acid-binding ACT domain-containing protein  71.63 
 
 
143 aa  205  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2132  amino acid-binding ACT domain-containing protein  68.31 
 
 
143 aa  202  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0184772  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1859  amino acid-binding ACT domain protein  69.5 
 
 
143 aa  202  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00254903  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2191  amino acid-binding ACT domain protein  67.61 
 
 
143 aa  201  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1736  ACT domain-containing protein  68.09 
 
 
143 aa  200  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567956  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1670  amino acid-binding ACT domain-containing protein  68.09 
 
 
143 aa  199  8e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2036  amino acid-binding ACT domain protein  66.9 
 
 
143 aa  197  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000214069 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1824  ACT domain-containing protein  66.67 
 
 
143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2322  amino acid-binding ACT domain-containing protein  63.83 
 
 
143 aa  184  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2883  amino acid-binding ACT domain-containing protein  59.86 
 
 
143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3510  amino acid-binding ACT domain protein  56.34 
 
 
143 aa  168  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0260882  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0514  ACT domain-containing protein  58.45 
 
 
143 aa  169  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1570  ACT domain-containing protein  58.87 
 
 
143 aa  166  9e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0670  amino acid-binding ACT domain protein  56.03 
 
 
143 aa  160  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1575  amino acid-binding ACT domain-containing protein  56.72 
 
 
143 aa  157  5e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.114486  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0167  amino acid-binding ACT domain protein  55.63 
 
 
143 aa  156  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0616  ACT domain-containing protein  51.41 
 
 
143 aa  153  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0816  amino acid-binding ACT  51.08 
 
 
142 aa  151  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.842739  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1503  amino acid-binding ACT domain protein  51.77 
 
 
143 aa  150  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0832  amino acid-binding ACT domain-containing protein  51.85 
 
 
147 aa  149  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219299  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0040  amino acid-binding ACT domain-containing protein  45.77 
 
 
147 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0037  ACT domain-containing protein  45.77 
 
 
147 aa  130  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0261  amino acid-binding ACT domain-containing protein  43.61 
 
 
144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0053  amino acid-binding ACT domain protein  45.77 
 
 
147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0041  amino acid-binding ACT domain protein  45.77 
 
 
147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  43.97 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4321  ACT domain-containing protein  44.9 
 
 
149 aa  122  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1971  amino acid-binding ACT domain-containing protein  45.77 
 
 
142 aa  122  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0074  amino acid-binding ACT domain protein  45.07 
 
 
142 aa  122  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0860  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.55 
 
 
141 aa  122  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0495792  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0168  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.55 
 
 
141 aa  121  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0065  hypothetical protein  45.77 
 
 
142 aa  121  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1743  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.84 
 
 
141 aa  121  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.237603 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0069  amino acid-binding ACT domain protein  45.07 
 
 
142 aa  120  8e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0071  amino acid-binding ACT domain-containing protein  49.63 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2859  amino acid-binding ACT domain protein  41.26 
 
 
151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3086  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.11 
 
 
135 aa  117  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0210  acetolactate synthase small subunit  42.03 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.846842 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3082  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.13 
 
 
143 aa  115  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1579  amino acid-binding ACT domain protein  43.8 
 
 
142 aa  113  6.9999999999999995e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.210637 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1421  hypothetical protein  42.03 
 
 
151 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0708  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.96 
 
 
144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.464159  normal  0.126423 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2122  amino acid-binding ACT domain protein  44.8 
 
 
144 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06230  ACT domain-containing protein  36.17 
 
 
142 aa  104  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.58032  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1623  amino acid-binding ACT  40.58 
 
 
144 aa  104  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0208  amino acid-binding (ACT) protein  40.6 
 
 
145 aa  103  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0748  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.54 
 
 
143 aa  101  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00491505  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13420  ACT domain-containing protein  41.01 
 
 
142 aa  100  6e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_885  ACT domain protein  36.72 
 
 
129 aa  100  8e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0901  ACT domain-containing protein  37.9 
 
 
129 aa  100  9e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1014  ACT domain-containing protein  35.94 
 
 
129 aa  99.4  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1455  hypothetical protein  35.07 
 
 
144 aa  92.8  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.323054 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1319  ACT domain-containing protein  35.92 
 
 
144 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1584  amino acid-binding ACT domain protein  37.5 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0505283 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0909  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.69 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.394001  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0720  putative acetolactate synthase small regulatory subunit  30.83 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.726001 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2427  amino acid-binding ACT domain protein  36 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.662665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2514  amino acid-binding ACT domain protein  35 
 
 
129 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1433  ACT domain-containing protein  34 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.50436  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3113  amino acid-binding ACT domain protein  34.82 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2396  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35 
 
 
129 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0873  amino acid-binding ACT  27.07 
 
 
152 aa  50.4  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1309  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.43 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2624  acetolactate synthase, small subunit  38.98 
 
 
160 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1107  acetolactate synthase small subunit  24.43 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0326  hypothetical protein  26.26 
 
 
125 aa  44.7  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2879  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555565 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3982  aspartate kinase  28.78 
 
 
421 aa  41.2  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>