19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0622 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0622  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  401  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0416  hypothetical protein  63.33 
 
 		 345 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.848373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0438  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.85 
 
 		 316 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3346  hypothetical protein  38.22 
 
 		 331 aa  98.6  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.66 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  34.94 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.79 
 
 		 300 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  33.54 
 
 		 294 aa  50.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  33.14 
 
 		 297 aa  48.5  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  30.86 
 
 		 317 aa  47  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0563  hypothetical protein  25.39 
 
 		 320 aa  44.7  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  34.21 
 
 		 308 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1038  hypothetical protein  29.76 
 
 		 273 aa  42.7  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000348344  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.59 
 
 		 289 aa  42.7  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.36 
 
 		 295 aa  42.4  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  31.1 
 
 		 304 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0742  hypothetical protein  27.37 
 
 		 314 aa  41.6  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  26.28 
 
 		 308 aa  41.6  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  26.28 
 
 		 308 aa  41.6  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>