42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4016 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4016  malonate decarboxylase  100 
 
 		 222 aa  440  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2046  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  39.18 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1273  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  38.34 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0280828  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0792  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  38.34 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.147641  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1245  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  36.41 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0753275 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1163  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  38.14 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.707422  normal  0.167545 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0790  malonate decarboxylase  39.67 
 
 		 229 aa  92.4  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00220342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1151  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  38.66 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3188  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  35.82 
 
 		 245 aa  85.1  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.605974 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4416  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  34.47 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5370  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  36.49 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0548916  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0075  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  36.24 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3155  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  32.74 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1764  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  36.46 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1077  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  35.18 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0050  hypothetical protein  34.05 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.390549  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4290  hypothetical protein  34.33 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2892  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  32.96 
 
 		 252 aa  71.6  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0787604  normal  0.0710753 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2496  hypothetical protein  28.96 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1847  malonate decarboxylase  32.71 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.705884  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0171  hypothetical protein  31.44 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.846138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0029  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  31.55 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0520843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6853  hypothetical protein  30.32 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0028  hypothetical protein  33.16 
 
 		 218 aa  62  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.920505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2799  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  32.61 
 
 		 294 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0976082  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1142  putative malonate decarboxylase, subunit E  25.22 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0172841  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1456  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  31.88 
 
 		 308 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0184396  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1486  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  31.88 
 
 		 308 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876381  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5297  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  30.54 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364033  normal  0.458128 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0543  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  31.88 
 
 		 308 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39768  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0610  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  31.88 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1260  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  31.88 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1587  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  31.88 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3033  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  31.88 
 
 		 308 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.623128  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10330  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  30.41 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0297  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  32.94 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4721  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5082  malonate decarboxylase subunit, putative  30.15 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02610  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  31.18 
 
 		 230 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3655  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  31.76 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4930  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  29.24 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835244  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2878  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  29.26 
 
 		 204 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.959484 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0447  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  29.61 
 
 		 213 aa  41.6  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>