22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3655 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3655  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  100 
 
 		 209 aa  427  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0951  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  33.49 
 
 		 230 aa  132  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4930  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  31.94 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835244  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10330  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  34.78 
 
 		 212 aa  126  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1241  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  36.63 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136886  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3870  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  31.9 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4946  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  31.9 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2443  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  32.67 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4588  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  33.01 
 
 		 221 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0297  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  32.85 
 
 		 230 aa  111  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4721  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02610  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  33.33 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2878  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  31.71 
 
 		 204 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.959484 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5297  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  31.19 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364033  normal  0.458128 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1849  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  30.43 
 
 		 233 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.30672  normal  0.0777522 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3773  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  34.29 
 
 		 205 aa  101  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.010064 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2606  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  35.29 
 
 		 204 aa  101  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66458  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4816  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  28.64 
 
 		 232 aa  98.6  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0582572  normal  0.0156096 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0447  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  30.35 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5082  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  27.75 
 
 		 237 aa  95.1  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147701  normal  0.175078 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5082  malonate decarboxylase subunit, putative  29.65 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4016  malonate decarboxylase  31.76 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1327  hypothetical protein  25 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>