23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0297 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0297  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  100 
 
 		 230 aa  440  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4721  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02610  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  85.22 
 
 		 230 aa  347  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5297  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  53.88 
 
 		 206 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364033  normal  0.458128 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10330  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  56.25 
 
 		 212 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2878  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  55.07 
 
 		 204 aa  184  8e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.959484 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2443  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  53.2 
 
 		 204 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0447  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  49.76 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5082  malonate decarboxylase subunit, putative  51.98 
 
 		 211 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3870  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  42.72 
 
 		 211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4946  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  42.72 
 
 		 211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4816  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  41.23 
 
 		 232 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0582572  normal  0.0156096 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3773  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  37.93 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.010064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0951  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  42.23 
 
 		 230 aa  118  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4930  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  38.54 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835244  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5082  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  38.73 
 
 		 237 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147701  normal  0.175078 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4588  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  35.16 
 
 		 221 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3655  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  32.85 
 
 		 209 aa  111  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1849  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  39.34 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.30672  normal  0.0777522 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1241  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  40.29 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136886  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2606  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  37.75 
 
 		 204 aa  109  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66458  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4016  malonate decarboxylase  32.94 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1764  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  31.38 
 
 		 237 aa  48.9  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1062  hypothetical protein  29.66 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>