25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2878 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2878  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  100 
 
 		 204 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.959484 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2443  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  73.53 
 
 		 204 aa  291  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10330  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  59.7 
 
 		 212 aa  207  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5297  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  54.15 
 
 		 206 aa  204  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364033  normal  0.458128 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0447  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  55.56 
 
 		 213 aa  194  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5082  malonate decarboxylase subunit, putative  55.45 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0297  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  55.07 
 
 		 230 aa  184  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4721  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02610  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  54.11 
 
 		 230 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3870  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  46.6 
 
 		 211 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4946  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  46.6 
 
 		 211 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4930  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  40.19 
 
 		 219 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835244  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4816  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  41.67 
 
 		 232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0582572  normal  0.0156096 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3773  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  42.08 
 
 		 205 aa  125  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.010064 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5082  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  43.01 
 
 		 237 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147701  normal  0.175078 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4588  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  37.2 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1849  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  40.69 
 
 		 233 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.30672  normal  0.0777522 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0951  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  40.95 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2606  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  42.31 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66458  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1241  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  40 
 
 		 205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136886  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3655  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  31.71 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1273  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  35.48 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0280828  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0792  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  35.48 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.147641  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1077  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  32.17 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4016  malonate decarboxylase  29.26 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1764  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  32.95 
 
 		 237 aa  41.2  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>