35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3188 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3188  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  100 
 
 		 245 aa  473  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.605974 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2046  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  46.83 
 
 		 222 aa  151  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3155  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  45.05 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1245  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  44.95 
 
 		 222 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0753275 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0792  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  44.95 
 
 		 222 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.147641  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1273  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  44.95 
 
 		 222 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0280828  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1163  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  45.41 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.707422  normal  0.167545 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4416  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  47.32 
 
 		 232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0050  hypothetical protein  45.58 
 
 		 219 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.390549  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6853  hypothetical protein  43.17 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4290  hypothetical protein  45.12 
 
 		 209 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0028  hypothetical protein  44.55 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.920505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1151  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  44.5 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0171  hypothetical protein  42.06 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.846138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0029  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  42.45 
 
 		 219 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0520843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2799  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  45.33 
 
 		 294 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0976082  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0790  malonate decarboxylase  38.03 
 
 		 229 aa  102  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00220342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1077  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  37.3 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1260  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  44.67 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0543  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  44.67 
 
 		 308 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39768  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1486  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  44.67 
 
 		 308 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876381  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1456  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  44.67 
 
 		 308 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0184396  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0610  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  44.67 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1587  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  44.67 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3033  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  44.67 
 
 		 308 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.623128  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4016  malonate decarboxylase  35.82 
 
 		 222 aa  85.1  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5370  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  35.45 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0548916  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0075  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  34.65 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1764  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  32.3 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2892  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  30.19 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0787604  normal  0.0710753 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1847  malonate decarboxylase  29.28 
 
 		 231 aa  52.8  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.705884  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2496  hypothetical protein  25 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1062  hypothetical protein  32.28 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3293  hypothetical protein  30.57 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1142  putative malonate decarboxylase, subunit E  27.22 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0172841  normal  0.360178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>