18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3293 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3293  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1062  hypothetical protein  70.46 
 
 		 244 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1327  hypothetical protein  37.75 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6853  hypothetical protein  32.94 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0050  hypothetical protein  34.94 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.390549  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3155  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  31.96 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0028  hypothetical protein  34.93 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.920505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0029  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  35.37 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0520843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4290  hypothetical protein  32.12 
 
 		 209 aa  53.1  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0790  malonate decarboxylase  31.65 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00220342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3188  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  30.57 
 
 		 245 aa  48.9  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.605974 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1077  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  26.14 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1847  malonate decarboxylase  28.18 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.705884  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1245  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  35.23 
 
 		 222 aa  45.1  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0753275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1764  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  31.78 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1273  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  34.15 
 
 		 222 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0280828  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0792  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  34.15 
 
 		 222 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.147641  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0171  hypothetical protein  33.51 
 
 		 219 aa  42  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.846138 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>