32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0171 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0171  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  410  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.846138 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3155  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  59.62 
 
 		 218 aa  231  9e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6853  hypothetical protein  59.62 
 
 		 218 aa  228  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0050  hypothetical protein  54.93 
 
 		 219 aa  208  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.390549  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0028  hypothetical protein  59 
 
 		 218 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.920505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0029  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  57.5 
 
 		 219 aa  198  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0520843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2046  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  50.52 
 
 		 222 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0792  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  51.05 
 
 		 222 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.147641  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1273  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  51.05 
 
 		 222 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0280828  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1163  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  50 
 
 		 222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.707422  normal  0.167545 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1151  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  50.53 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1245  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  50 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0753275 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4416  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  50 
 
 		 232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3188  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  42.06 
 
 		 245 aa  125  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.605974 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3033  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  47.62 
 
 		 308 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.623128  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0543  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  47.62 
 
 		 308 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39768  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1486  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  47.62 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876381  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0610  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  47.92 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1260  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  47.92 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1456  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  46.85 
 
 		 308 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0184396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1587  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  46.85 
 
 		 307 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4290  hypothetical protein  41.15 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2799  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  44.76 
 
 		 294 aa  94.7  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0976082  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0790  malonate decarboxylase  39.61 
 
 		 229 aa  85.1  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00220342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0075  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  35.45 
 
 		 253 aa  81.6  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1077  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  34.72 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5370  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  34.95 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0548916  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4016  malonate decarboxylase  31.44 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1847  malonate decarboxylase  29.55 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.705884  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1764  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  32.88 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2496  hypothetical protein  24.89 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2892  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  50.91 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0787604  normal  0.0710753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>