27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3976 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3976  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  538  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.834147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3251  hypothetical protein  73.08 
 
 		 264 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6720  hypothetical protein  72.31 
 
 		 264 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3035  hypothetical protein  75 
 
 		 264 aa  394  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000133593  unclonable  0.00000211782 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3795  hypothetical protein  71.07 
 
 		 267 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1143  extracellular solute-binding protein  22.81 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00243654  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  24.27 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.27 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0299  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  28.85 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  24.27 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.27 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.27 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.27 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.79 
 
 		 259 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2849  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 261 aa  45.8  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.79 
 
 		 259 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0483  hypothetical protein  31.58 
 
 		 292 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1729  CjaC  26.2 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0619  hypothetical protein  22.05 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.566502  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0499  extracellular solute-binding protein  22.58 
 
 		 457 aa  44.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.79 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2389  extracellular solute-binding protein family 3  25.48 
 
 		 260 aa  42.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.68817  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2029  extracellular solute-binding protein family 3  23.45 
 
 		 275 aa  42.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00497658  hitchhiker  0.00148627 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 		 254 aa  42.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3995  extracellular solute-binding protein  23.19 
 
 		 259 aa  42  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0155411  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0316  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 255 aa  42.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000382447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>