51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3795 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3795  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  549  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6720  hypothetical protein  78.71 
 
 		 264 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3035  hypothetical protein  73.38 
 
 		 264 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000133593  unclonable  0.00000211782 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3251  hypothetical protein  74.41 
 
 		 264 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3976  hypothetical protein  71.07 
 
 		 260 aa  376  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.834147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2029  extracellular solute-binding protein family 3  27.8 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00497658  hitchhiker  0.00148627 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  22.18 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1729  CjaC  26.37 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  27.15 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1455  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.57 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000239011  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3412  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1143  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00243654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 255 aa  49.7  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  22.6 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1070  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 281 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.703712 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0489  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33 
 
 		 490 aa  47.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2849  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3922  extracellular solute-binding protein family 3  22.75 
 
 		 282 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.0650452 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1454  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.87 
 
 		 265 aa  46.2  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00353635  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  21.48 
 
 		 253 aa  45.8  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 277 aa  45.8  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1231  extracellular solute-binding protein  22.07 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000126239  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3082  extracellular solute-binding protein family 3  22.07 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00109919  hitchhiker  0.00184496 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2353  extracellular solute-binding protein family 3  22.43 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.09811e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  21.8 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  21.8 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13330  amino acid-binding protein  23.11 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  21.8 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0395  extracellular solute-binding protein  21.48 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  21.8 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  21.8 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  21.8 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  19.35 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1308  extracellular solute-binding protein  22.07 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178396  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1275  extracellular solute-binding protein  22.07 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000731969  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6986  extracellular solute-binding protein family 3  25.81 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  35.06 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5123  extracellular solute-binding protein family 3  24.02 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2120  multisensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 682 aa  43.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  21.33 
 
 		 259 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2389  extracellular solute-binding protein family 3  22.76 
 
 		 260 aa  42.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.68817  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1142  extracellular solute-binding protein  21.49 
 
 		 292 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 271 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 275 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  24.83 
 
 		 246 aa  42.4  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  21.33 
 
 		 259 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  22.18 
 
 		 266 aa  42.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 		 283 aa  42.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>