36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3746 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3746  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  450  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3312  hypothetical protein  29.52 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1205  putative signal transduction protein  34.95 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0344  putative signal transduction protein  35.9 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.961814  normal  0.37345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5126  putative signal transduction protein  32.41 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  31.19 
 
 		 290 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2909  metal-dependent phosphohydrolase  31.07 
 
 		 281 aa  64.7  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.600973  normal  0.363943 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4164  hypothetical protein  35 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.511552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  31.19 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4198  putative signal transduction protein  34.15 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  28.44 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  28.04 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  32.93 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0875  signal transduction protein  33.33 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  32.53 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3751  putative signal transduction protein  32.63 
 
 		 288 aa  58.2  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0794066 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4762  hypothetical protein  27.1 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.08639 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2008  putative signal transduction protein  29.89 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218078 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0413  hypothetical protein  29.91 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1512  putative signal transduction protein  25.12 
 
 		 293 aa  53.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  21.97 
 
 		 282 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  26.61 
 
 		 284 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  29.21 
 
 		 378 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0704  hypothetical protein  34.21 
 
 		 279 aa  48.9  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.670441  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  25.19 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  24.81 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 		 544 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  25.13 
 
 		 718 aa  45.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  28.57 
 
 		 302 aa  45.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  28.74 
 
 		 282 aa  45.1  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  28.46 
 
 		 298 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  28.77 
 
 		 284 aa  43.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  21.43 
 
 		 284 aa  42.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  37.5 
 
 		 279 aa  42.4  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 		 285 aa  41.6  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  28.21 
 
 		 280 aa  41.6  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>