66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2625 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2625  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  229  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.511113 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2251  hypothetical protein  85.59 
 
 		 111 aa  194  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4153  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  30.63 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  28.83 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  29.73 
 
 		 112 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  27.93 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  28.83 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  27.93 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  28.83 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0659  nitrogen regulatory protein P-II  30.28 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769311  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  25.23 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  25.66 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  24.53 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  25.23 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2735  nitrogen regulatory protein P-II  25.23 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  25.23 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  25.23 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3983  nitrogen regulatory protein P-II  26.13 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295066  normal  0.22558 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  25.23 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0380  nitrogen regulatory protein P-II  27.03 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  26.13 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  29.25 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  25.23 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0881  nitrogen regulatory protein P-II  24.53 
 
 		 112 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24631  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  25.23 
 
 		 112 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  26.13 
 
 		 112 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  26.13 
 
 		 112 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  25.23 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  26.13 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  25.23 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  24.32 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  24.32 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  25.23 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  24.32 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  24.32 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  24.32 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  25.23 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0535  nitrogen regulatory protein P-II  27.93 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.862909  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  26.13 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2842  nitrogen regulatory protein P-II  24.32 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  25.23 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0456  nitrogen regulatory protein P-II  23.42 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  25.23 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  25.23 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  25.23 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  25.23 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  25.23 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  25.23 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  25.23 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  25.23 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  26.13 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  25.23 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  25.23 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  25.23 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  25.23 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  25.23 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  21.62 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  24.32 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  26.13 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2206  nitrogen regulatory protein P-II  25.23 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.642209  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0831  nitrogen regulatory protein P-II, putative  27.03 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0317945  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  24.53 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  23.42 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1066  nitrogen regulatory protein P-II  23.58 
 
 		 112 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.775357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  24.32 
 
 		 112 aa  40  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>