More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3983 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3983  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
130 aa  254  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295066  normal  0.22558 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0615  nitrogen regulatory protein P-II  76.86 
 
 
133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.730291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7264  nitrogen regulatory protein P-II precursor  54.46 
 
 
121 aa  110  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.143517  normal  0.700231 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4532  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  54.55 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2211  nitrogen regulatory protein P-II  40.38 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  33.02 
 
 
112 aa  72  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  38.05 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  35.58 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  39.42 
 
 
112 aa  70.1  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  37.27 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  34.62 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1109  nitrogen regulatory protein P-II 2  33.65 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0216976  hitchhiker  0.00000214142 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  34.62 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2536  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  35.58 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.679414  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2479  nitrogen regulatory protein P-II  36.54 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494885  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  38.46 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  37.17 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3251  nitrogen regulatory protein P-II 2  33.65 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.534488  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0275  nitrogen regulatory protein P-II  39.42 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1762  nitrogen regulatory protein P-II  38.46 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  36.54 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1060  nitrogen regulatory protein P-II 2  33.65 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3078  nitrogen regulatory protein P-II 2  33.65 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3039  nitrogen regulatory protein P-II 2  33.65 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.437205 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3057  nitrogen regulatory protein P-II 2  33.65 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3220  nitrogen regulatory protein P-II 2  33.65 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1960  nitrogen regulatory protein P-II  38.46 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  36.54 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2865  nitrogen regulatory protein P-II 2  33.65 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4874  nitrogen regulatory protein P-II  36.54 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  33.65 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  36.54 
 
 
114 aa  67.4  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  35.85 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  37.27 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  37.27 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0642  nitrogen regulatory protein  32.69 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0626  nitrogen regulatory protein  32.69 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  37.27 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  37.27 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  37.27 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  37.27 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  38.46 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  37.27 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  37.27 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  38.46 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0918  nitrogen regulatory protein P-II 2  31.73 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00402  nitrogen assimilation regulatory protein for GlnL, GlnE, and AmtB  30.77 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3165  nitrogen regulatory protein P-II 2  30.77 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3159  nitrogen regulatory protein P-II  30.77 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  36.54 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0539  nitrogen regulatory protein P-II 2  30.77 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.843641  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0527  nitrogen regulatory protein P-II 2  30.77 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  38.46 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0486  nitrogen regulatory protein P-II 2  30.77 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  36.54 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00406  hypothetical protein  30.77 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0494  nitrogen regulatory protein P-II 2  30.77 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  35.58 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0377  nitrogen regulatory protein P-II 2  30.77 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1123  nitrogen regulatory protein P-II  35.58 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.727128  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1304  nitrogen regulatory protein P-II  35.58 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.774193  normal  0.209326 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 
112 aa  67  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1089  nitrogen regulatory protein P-II  35.58 
 
 
112 aa  67  0.00000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.101953  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  37.27 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  34.62 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  34.62 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2604  nitrogen regulatory protein P-II  32.69 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320307  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  37.27 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  37.27 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  37.27 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  34.62 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  36.19 
 
 
114 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  37.27 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  35.58 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  36.54 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  34.62 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  32.69 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  36.54 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0371  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  38.46 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  35.58 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  36.54 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  35.58 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2842  nitrogen regulatory protein P-II  36.54 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  36.54 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  35.58 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  36.54 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  35.58 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  35.58 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03437  hypothetical protein  33.65 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0650  nitrogen regulatory protein P-II  34.62 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.367034  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2546  nitrogen regulatory protein P-II  37.14 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.164416 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  36.54 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  33.65 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  35.24 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  36.54 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  35.58 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  36.54 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>