49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2251 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2251  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  226  8e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2625  nitrogen regulatory protein P-II  85.59 
 
 		 112 aa  194  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.511113 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4153  nitrogen regulatory protein P-II  36.04 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  30.91 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  29.09 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  31.43 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  29.09 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  29.09 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  29.09 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  31.03 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  29.09 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  30 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  28.57 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  30 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  29.09 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  30 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  30 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  30 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  30 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  30 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2735  nitrogen regulatory protein P-II  26.13 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  30 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  30 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  30 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  30 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  30 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  29.09 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  30 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  30 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  28.83 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  30 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  29.09 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  30 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  29.09 
 
 		 112 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  26.79 
 
 		 111 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0456  nitrogen regulatory protein P-II  26.13 
 
 		 112 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0137  nitrogen regulatory protein P-II  26.13 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000150493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  30.17 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  26.36 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  29.31 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2525  nitrogen regulatory protein P-II  28.3 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.720129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  29.09 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  29.09 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  29.09 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  29.09 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0380  nitrogen regulatory protein P-II  26.13 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  27.93 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  29.09 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  28.45 
 
 		 112 aa  40  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>