79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1530 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1530  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  100 
 
 		 146 aa  301  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3056  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  99.29 
 
 		 476 aa  294  4e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.905986  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0633  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  51.75 
 
 		 157 aa  166  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.283421  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0746  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  37.07 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3381  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  32.28 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3934  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  31.11 
 
 		 399 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6734  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.9 
 
 		 344 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8617  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.21 
 
 		 545 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3384  hypothetical protein  46.27 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8278  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.21 
 
 		 545 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7841  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.21 
 
 		 545 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0088  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.93 
 
 		 546 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0719331 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0035  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.93 
 
 		 546 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05360  transposase family protein  30.77 
 
 		 428 aa  62  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22120  transposase family protein  30.77 
 
 		 428 aa  62  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.523931  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26440  transposase family protein  30.77 
 
 		 428 aa  62  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4809  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.73 
 
 		 361 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4953  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.05 
 
 		 518 aa  60.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2166  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  32.53 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000653372 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0323  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  32.53 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00100796  hitchhiker  0.000174276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0443  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  32.53 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0800  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  32.53 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1310  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  32.53 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0706375  normal  0.603162 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1977  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  32.53 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00749361  hitchhiker  0.0098642 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2284  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  32.53 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0613621  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2376  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  32.53 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000671414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2515  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  32.53 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.957885  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3102  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  32.53 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2840  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  32.53 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000161763  hitchhiker  3.30659e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3527  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  32.53 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3396  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  32.53 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.838186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1562  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.08 
 
 		 395 aa  58.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0215492  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3814  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.67 
 
 		 549 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6189  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.79 
 
 		 562 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.984628  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1348  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.08 
 
 		 395 aa  58.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1186  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.08 
 
 		 395 aa  58.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1023  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.08 
 
 		 395 aa  58.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0717423  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0351  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.08 
 
 		 395 aa  58.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.172822  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1434  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.08 
 
 		 395 aa  57.8  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.395404  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3281  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32 
 
 		 518 aa  58.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0194889 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1437  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.08 
 
 		 395 aa  57.8  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.12833  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0249  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.08 
 
 		 395 aa  57.8  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.983773  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6768  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.09 
 
 		 501 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.403374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3262  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.9 
 
 		 518 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00994132 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5451  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.81 
 
 		 536 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.268297 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1185  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  32.89 
 
 		 364 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0738  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.34 
 
 		 436 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0040  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.34 
 
 		 436 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4581  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.34 
 
 		 436 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22250  transposase family protein  25.77 
 
 		 457 aa  54.7  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2272  ISL3 family transposase  27.68 
 
 		 539 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00373654  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5033  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.7 
 
 		 570 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.681228  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3856  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.84 
 
 		 391 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20460  transposase  25.26 
 
 		 407 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0995165  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19680  transposase  25.26 
 
 		 407 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16150  transposase  25.26 
 
 		 407 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0918  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.84 
 
 		 391 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2172  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.12 
 
 		 407 aa  51.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1438  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.25 
 
 		 391 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4191  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  25.49 
 
 		 229 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3733  hypothetical protein  26.74 
 
 		 339 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4089  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  44.44 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3974  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.93 
 
 		 520 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0649  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.44 
 
 		 391 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3433  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.44 
 
 		 391 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3286  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.44 
 
 		 391 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2445  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.44 
 
 		 391 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.08593  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2328  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.44 
 
 		 391 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1314  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.44 
 
 		 391 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0608  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.44 
 
 		 391 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0565  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.44 
 
 		 391 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2573  ISRSO15-transposase protein  29.09 
 
 		 406 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1547  ISRSO15-transposase protein  29.09 
 
 		 406 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.355973 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4482  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25 
 
 		 408 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4138  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.74 
 
 		 511 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.609635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4034  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25 
 
 		 408 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3509  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25 
 
 		 408 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1816  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25 
 
 		 408 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2977  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25 
 
 		 408 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>