36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0755 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0755  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  100 
 
 		 155 aa  310  3.9999999999999997e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.266984  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3744  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  52.67 
 
 		 155 aa  164  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.374657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2569  carbohydrate kinase  30.25 
 
 		 373 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00777638  hitchhiker  0.0000000380765 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1289  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0860  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.89 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.346513 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0647  tripartite ATP-independent periplasmic (TRAP) C4-dicarboxylate transporter subunit DctQ  32 
 
 		 173 aa  47  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.784671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04933  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system permease component  26.21 
 
 		 180 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4915  C4-dicarboxylate transporter family protein, DctQ subunit  25.21 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3965  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.08 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.123911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4881  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.46 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0760  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.66 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0299127  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3144  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  27.07 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.36824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3318  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.43 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00300706  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2238  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  28.45 
 
 		 167 aa  44.3  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1304  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  39.29 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.678951  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2034  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.83 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00133922  normal  0.0453092 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1073  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.09 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1274  TRAP dicarboxylate transporter- DctM subunit  25 
 
 		 635 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0864144  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000630  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system small permease component  23.26 
 
 		 185 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0492  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  25.27 
 
 		 634 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.189133 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3587  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.4 
 
 		 173 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.677998  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1931  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  28.41 
 
 		 640 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03429  predicted transporter  26.27 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03380  hypothetical protein  26.27 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0133  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  26.27 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3945  2,3-diketo-L-gulonate TRAP transporter small permease protein YiaM  26.27 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3900  2,3-diketo-L-gulonate TRAP transporter small permease protein YiaM  26.27 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4074  2,3-diketo-L-gulonate TRAP transporter small permease protein YiaM  26.27 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3781  2,3-diketo-L-gulonate TRAP transporter small permease protein YiaM  26.27 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0558  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  26.32 
 
 		 159 aa  41.2  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2756  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  24.78 
 
 		 628 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.95761  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4339  trap dicarboxylate transporter subunit DctQ  26.09 
 
 		 171 aa  40.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4383  trap dicarboxylate transporter subunit DctQ  26.09 
 
 		 171 aa  40.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.725084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4270  trap dicarboxylate transporter dctq subunit  26.09 
 
 		 171 aa  40.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.299964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4299  trap dicarboxylate transporter, dctq subunit  26.09 
 
 		 171 aa  40.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4451  trap dicarboxylate transporter DctQ subunit  26.09 
 
 		 171 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>