22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2178 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2178  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  224  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0329  hypothetical protein  65.45 
 
 
110 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00407554  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0610  hypothetical protein  61.82 
 
 
110 aa  154  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0592  Protein of unknown function CGGC region  59.09 
 
 
109 aa  138  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2561  hypothetical protein  60 
 
 
110 aa  136  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532205  normal  0.242672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1935  hypothetical protein  59.09 
 
 
109 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000780834  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3511  hypothetical protein  57.27 
 
 
109 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4074  hypothetical protein  57.27 
 
 
109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2128  hypothetical protein  55.45 
 
 
110 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0650413  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0616  hypothetical protein  37.84 
 
 
110 aa  85.1  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00465566  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1294  hypothetical protein  29.73 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3666  hypothetical protein  31.53 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0268181 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1583  metal-binding protein  34.34 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2153  metal-binding protein-like  32.73 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0445  metal-binding protein-like protein  29 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0448  hypothetical protein  37.33 
 
 
125 aa  51.6  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0792  hypothetical protein  37.33 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000273798  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0357  hypothetical protein  29.52 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00834673  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1554  hypothetical protein  29.09 
 
 
137 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0127  hypothetical protein  27.19 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000103923  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3196  hypothetical protein  27.35 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00337649 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1530  hypothetical protein  30.09 
 
 
121 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00106363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>