22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1530 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1530  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  249  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00106363  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1294  hypothetical protein  35.65 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1031  hypothetical protein  30 
 
 
119 aa  64.7  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1397  hypothetical protein  31.97 
 
 
117 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.737899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3666  hypothetical protein  33.04 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0268181 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0445  metal-binding protein-like protein  32.11 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0580  hypothetical protein  36.89 
 
 
114 aa  52.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00926779  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3196  hypothetical protein  25.41 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00337649 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2153  metal-binding protein-like  30.56 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0616  hypothetical protein  31.36 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00465566  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1273  hypothetical protein  30 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2561  hypothetical protein  34.21 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532205  normal  0.242672 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1583  metal-binding protein  29.91 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0357  hypothetical protein  28.21 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00834673  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0443  hypothetical protein  28.26 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00458611  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0592  Protein of unknown function CGGC region  30.51 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0452  hypothetical protein  27.17 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0610  hypothetical protein  30.63 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0329  hypothetical protein  31.25 
 
 
110 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00407554  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3511  hypothetical protein  30.36 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2178  hypothetical protein  30.09 
 
 
110 aa  40.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1554  hypothetical protein  25.64 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.151422 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>