27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0445 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0445  metal-binding protein-like protein  100 
 
 		 148 aa  310  5.999999999999999e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2153  metal-binding protein-like  70.27 
 
 		 148 aa  243  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1583  metal-binding protein  56.93 
 
 		 147 aa  169  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0616  hypothetical protein  33.94 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00465566  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1294  hypothetical protein  31.82 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3666  hypothetical protein  29.73 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0268181 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1031  hypothetical protein  33.62 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0329  hypothetical protein  29.25 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00407554  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0610  hypothetical protein  34.38 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1530  hypothetical protein  32.11 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00106363  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2178  hypothetical protein  29 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2128  hypothetical protein  30.19 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0650413  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0592  Protein of unknown function CGGC region  30.19 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3196  hypothetical protein  31.86 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337649 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4074  hypothetical protein  28.3 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2561  hypothetical protein  28.3 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532205  normal  0.242672 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1480  hypothetical protein  31.34 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.265412  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1397  hypothetical protein  33.04 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.737899 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0448  hypothetical protein  30.58 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1273  hypothetical protein  27.83 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0443  hypothetical protein  26.13 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00458611  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0332  Protein of unknown function CGGC region  26.96 
 
 		 126 aa  42.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.19999e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0452  hypothetical protein  27.03 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1935  hypothetical protein  29 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000780834  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3511  hypothetical protein  29.29 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0357  hypothetical protein  27.87 
 
 		 137 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00834673  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1554  hypothetical protein  29.31 
 
 		 137 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>