19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4074 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_4074  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  222  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3511  hypothetical protein  86.24 
 
 		 109 aa  199  9e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1935  hypothetical protein  84.4 
 
 		 109 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000780834  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0592  Protein of unknown function CGGC region  71.56 
 
 		 109 aa  178  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2561  hypothetical protein  73.39 
 
 		 110 aa  177  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532205  normal  0.242672 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2128  hypothetical protein  66.06 
 
 		 110 aa  159  9e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0650413  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0329  hypothetical protein  60.91 
 
 		 110 aa  143  8.000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00407554  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2178  hypothetical protein  57.27 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0610  hypothetical protein  53.64 
 
 		 110 aa  124  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0616  hypothetical protein  34.23 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00465566  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1294  hypothetical protein  32.73 
 
 		 172 aa  63.5  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3666  hypothetical protein  31.82 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0268181 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1583  metal-binding protein  30.3 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0445  metal-binding protein-like protein  28.3 
 
 		 148 aa  47  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2153  metal-binding protein-like  30.48 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0448  hypothetical protein  31.51 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0792  hypothetical protein  31.19 
 
 		 126 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000273798  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1480  hypothetical protein  35.09 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.265412  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0357  hypothetical protein  28.57 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00834673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>