37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1294 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1294  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  352  2e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3666  hypothetical protein  60.55 
 
 		 114 aa  157  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0268181 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1480  hypothetical protein  57.35 
 
 		 67 aa  90.5  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.265412  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0616  hypothetical protein  37.61 
 
 		 110 aa  77  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00465566  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0357  hypothetical protein  36.84 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00834673  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2178  hypothetical protein  29.73 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0592  Protein of unknown function CGGC region  31.82 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0445  metal-binding protein-like protein  31.82 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2153  metal-binding protein-like  35.51 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1554  hypothetical protein  32.77 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1583  metal-binding protein  34.26 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1530  hypothetical protein  35.65 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00106363  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0329  hypothetical protein  32.73 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00407554  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1935  hypothetical protein  32.43 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000780834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4074  hypothetical protein  32.73 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3511  hypothetical protein  35.42 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2561  hypothetical protein  30.28 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532205  normal  0.242672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3196  hypothetical protein  29.31 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337649 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0610  hypothetical protein  31.19 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0443  hypothetical protein  33.64 
 
 		 107 aa  60.5  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00458611  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2128  hypothetical protein  30.85 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0650413  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0452  hypothetical protein  32.73 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1031  hypothetical protein  31.3 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0792  hypothetical protein  29.31 
 
 		 126 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000273798  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1273  hypothetical protein  28.7 
 
 		 117 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0748  proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  45.1 
 
 		 263 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0448  hypothetical protein  29.84 
 
 		 125 aa  48.5  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1397  hypothetical protein  30.77 
 
 		 117 aa  48.1  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.737899 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0580  hypothetical protein  34.78 
 
 		 114 aa  44.7  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00926779  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  45.83 
 
 		 535 aa  43.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  42.55 
 
 		 526 aa  42.4  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4376  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  42.55 
 
 		 61 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4438  Proto-chlorophyllide reductase 57 kD subunit  42.55 
 
 		 61 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0931404 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  39.58 
 
 		 535 aa  41.6  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  41.67 
 
 		 532 aa  41.2  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0160  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  40 
 
 		 519 aa  40.8  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  43.75 
 
 		 535 aa  40.8  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>