13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0792 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0792  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  264  2.9999999999999995e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000273798  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0448  hypothetical protein  55.65 
 
 
125 aa  152  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3666  hypothetical protein  32.76 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0268181 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0592  Protein of unknown function CGGC region  33.02 
 
 
109 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1294  hypothetical protein  29.31 
 
 
172 aa  50.8  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2561  hypothetical protein  32.11 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532205  normal  0.242672 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2178  hypothetical protein  37.33 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0616  hypothetical protein  35.44 
 
 
110 aa  44.7  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00465566  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2128  hypothetical protein  32.43 
 
 
110 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0650413  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1935  hypothetical protein  31.13 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000780834  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3511  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4074  hypothetical protein  31.19 
 
 
109 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0329  hypothetical protein  32.88 
 
 
110 aa  40.8  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00407554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>