16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0448 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0448  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  256  7e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0792  hypothetical protein  55.65 
 
 
126 aa  152  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000273798  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0616  hypothetical protein  40.51 
 
 
110 aa  53.9  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00465566  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2178  hypothetical protein  37.33 
 
 
110 aa  51.6  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3666  hypothetical protein  30.43 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0268181 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0592  Protein of unknown function CGGC region  32.88 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2128  hypothetical protein  34.67 
 
 
110 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0650413  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1294  hypothetical protein  29.84 
 
 
172 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2561  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532205  normal  0.242672 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3511  hypothetical protein  34.25 
 
 
109 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0329  hypothetical protein  37.84 
 
 
110 aa  46.2  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00407554  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1935  hypothetical protein  34.25 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000780834  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0445  metal-binding protein-like protein  30.58 
 
 
148 aa  45.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4074  hypothetical protein  31.51 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2153  metal-binding protein-like  29.75 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0610  hypothetical protein  35.62 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>