18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1935 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1935  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  224  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000780834  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3511  hypothetical protein  88.07 
 
 
109 aa  201  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4074  hypothetical protein  84.4 
 
 
109 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0592  Protein of unknown function CGGC region  73.39 
 
 
109 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2561  hypothetical protein  74.31 
 
 
110 aa  175  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532205  normal  0.242672 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2128  hypothetical protein  68.81 
 
 
110 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0650413  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0329  hypothetical protein  62.73 
 
 
110 aa  140  7e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00407554  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2178  hypothetical protein  59.09 
 
 
110 aa  134  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0610  hypothetical protein  53.64 
 
 
110 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0616  hypothetical protein  34.23 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00465566  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1294  hypothetical protein  32.43 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3666  hypothetical protein  30 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0268181 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1583  metal-binding protein  31 
 
 
147 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0448  hypothetical protein  34.25 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0792  hypothetical protein  31.13 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000273798  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0357  hypothetical protein  31.43 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00834673  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1480  hypothetical protein  33.33 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.265412  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0445  metal-binding protein-like protein  29 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>